侵染中华蜜蜂6日龄幼虫的蜜蜂球囊菌的微小RNA差异表达谱及调控网络 |
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作者姓名: | 熊翠玲 杜宇 冯睿蓉 蒋海宾 史小玉 王海朋 范小雪 王杰 祝智威 范元婵 陈华枝 周丁丁 郑燕珍 陈大福 郭睿 |
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作者单位: | 福建农林大学动物科学学院(蜂学学院), 福建 福州 350002 |
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基金项目: | 国家自然科学基金(31702190);现代农业产业技术体系建设专项资金(CARS-44-KXJ7);福建省教育厅中青年教师教育科研项目(JAT170158);福建农林大学杰出青年科研人才计划(xjq201814);福建农林大学科技创新专项基金(CXZX2017342,CXZX2017343);福建省大学生创新创业训练计划(201910389011,201810389029,201810389082) |
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摘 要: | 【目的】蜜蜂球囊菌(Ascosphaeraapis,简称球囊菌)是专性侵染蜜蜂幼虫的致死性真菌病原。MicroRNA(miRNA)作为一类重要的基因表达调控因子,能够广泛参与真菌及其宿主的相互作用过程。本研究通过比较分析球囊菌孢子(AaCK)和侵染中华蜜蜂(Apis cerana cerana,简称中蜂) 6日龄幼虫肠道内的球囊菌(AaT)的smallRNA(sRNA)组学数据对球囊菌的差异表达miRNA(differentiallyexpressed miRNA,DEmiRNA)、靶mRNA及二者间的调控网络进行全面解析,旨在揭示miRNA介导的球囊菌对中蜂幼虫的侵染机制。【方法】对于球囊菌侵染的中蜂6日龄幼虫肠道的small RNA-seq (sRNA-seq)数据,利用BLAST工具连续比对东方蜜蜂(Apiscerana)和球囊菌的参考基因组筛滤得到AaT的sRNA组学数据。分别将AaCK和AaT的sRNA组学数据比对miRBase数据库,对球囊菌侵染宿主前后miRNA的数量和结构特征进行分析。联用RNAhybrid+svmlight、Miranda和Tar...
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关 键 词: | 蜜蜂球囊菌 中华蜜蜂 幼虫 微小RNA 调控网络 侵染机制 跨界调控 |
收稿时间: | 2019-09-10 |
修稿时间: | 2019-11-06 |
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