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基于深度学习的水稻表型特征提取和穗质量预测研究
作者姓名:杨万里  段凌凤  杨万能
作者单位:华中农业大学工学院,武汉 430070;华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室,武汉 430070
基金项目:国家自然科学基金面上项目(31770397); 国家自然科学基金青年项目(31701317)
摘    要:水稻产量与水稻穗数和穗质量密切相关,精确预测水稻产量可以加快育种速度。以盆栽水稻为研究对象,首先利用可见光图像结合图像处理技术进行特征提取,获取整株水稻的51个表型特征。结合深度学习,运用Faster R-CNN卷积神经网络训练模型对水稻穗数进行检测,同时使用SegNet网络框架训练得到的模型对水稻稻穗进行分割,得到水稻穗部的二值图像,结合图像处理技术提取穗部的33个表型特征数据。提取了颜色、形态、纹理共85个表型参数,对所有85个数据进行归一化处理,将归一化的85个表型数据与稻穗鲜质量、干质量进行逐步线性回归,挑选相关性高的特征数据。分别使用穗数和33个特征穗部、51个特征整株、所有85个特征中相关性高的特征数据构建盆栽水稻稻穗鲜质量、干质量的预测模型,最后根据模型的决定系数R2、平均相对误差(MAPE)和相对误差绝对值的标准差(SAPE)挑选最优预测模型。预测结果表明穗部特征预测效果最好,其中效果最好的模型鲜质量、干质量预测值与真实值的决定系数R2分别达到0.787±0.051和0.840±0.054。

关 键 词:水稻产量预测  植物表型组学  深度学习  图像处理  水稻穗质量预测  SegNet  Faster R-CNN
收稿时间:2020-06-15
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