| 柑橘鳞皮病毒3个分离物全基因组序列分析 |
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| 引用本文： | 李敏,周天宇,张松,杨方云,周彦,周常勇,李中安,曹孟籍. 柑橘鳞皮病毒3个分离物全基因组序列分析[J]. 园艺学报, 2018, 45(10): 2030-2036. DOI: 10.16420/j.issn.0513-353x.2018-0172 |
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| 作者姓名： | 李敏 周天宇 张松 杨方云 周彦 周常勇 李中安 曹孟籍 |
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| 作者单位： | 西南大学/中国农业科学院柑桔研究所，重庆 400712 |
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| 基金项目： | 国家重点研发计划政府间国际科技创新合作重点专项（2017YFE0110900）；重庆市科委社会事业与民生保障科技创新专项（cstc2016shms-ztzx800003）；重庆市基础科学与前沿技术研究专项（cstc2017jcyjBX0016）；国家自然科学基金项目（31501611）；重庆市研究生科研创新项目（CYS18133） |
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| 摘 要： | 运用转录组测序和RT-PCR方法克隆测定了柑橘鳞皮病毒（Citrus psorosis virus，CPsV）3个分离物CHN-1、CHN-2和CHN-3的全基因组。序列分析结果表明，CHN-1、CHN-2和CHN-3的基因组全长分别为11 282、11 279和11 278 nt，均包含4个开放阅读框。CHN-1、CHN-2和CHN-3之间的核苷酸相似性为93.48% ~ 95.98%，编码氨基酸相似性为98.18% ~ 98.86%；与6个已知国外CPsV分离物的外壳蛋白基因核苷酸序列相似性为85.83% ~ 95.23%，其对应氨基酸序列相似性为94.09% ~ 99.32%。系统进化分析显示CHN-1、CHN-2和CHN-3与地中海沿岸国家的CPsV分离物聚为一簇，可能具有共同的起源。
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| 关 键 词： | 柑橘 柑橘鳞皮病毒 全基因组 系统发育分析 |
Complete Genome Sequence Analysis of Three Citrus psorosis virus Isolates |
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| LI Min,ZHOU Tianyu,ZHANG Song,YANG Fangyun,ZHOU Yan,ZHOU Changyong,LI Zhongan,CAO Mengji. Complete Genome Sequence Analysis of Three Citrus psorosis virus Isolates[J]. Acta Horticulturae Sinica, 2018, 45(10): 2030-2036. DOI: 10.16420/j.issn.0513-353x.2018-0172 |
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| Authors: | LI Min ZHOU Tianyu ZHANG Song YANG Fangyun ZHOU Yan ZHOU Changyong LI Zhongan CAO Mengji |
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| Affiliation: | Citrus Research Institute，Southwest University/Chinese Academy of Agricultural Sciences，Chongqing 400712，China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Citrus Citrus psorosis virus genome phylogenetic analysis |
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