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黄花烟草K+通道基因NKCl克隆与序列分析
引用本文:郭兆奎,杨谦,颜培强,万秀清.黄花烟草K+通道基因NKCl克隆与序列分析[J].中国烟草学报,2008,14(5).
作者姓名:郭兆奎  杨谦  颜培强  万秀清
基金项目:国家烟草专卖局资助项目
摘    要:通过已知生物钾通道蛋白保守序列分析,设计兼并引物对钾饥饿处理的烟草幼根总RNA的反转录产物进行PCR扩增,分离到K 通道基因NKCl,该基因的cDNA阅读框由2481个核苷酸组成,编码的蛋白含有826个氨基酸(分子量为94.6KD),等电点为6.60;将核苷酸序列输入NCBI进行BlastX其同源序列大部分为高亲和K 转运体,与该基因同源性最高的是Solanum tuberosum钾通道基因SKT1,其氨基酸同源性为79%,预测该蛋白具有6个跨膜区域,采用同源模建方法预测了NKC蛋白活性区域的3维结构.同时,特异性转录分析发现NKCl基因在烟草幼根、叶片和花各器官均有表达,而以幼根组织中转录量最多;缺钾处理可显著诱导根系中NKC基因的转录,而高浓度NH4 处理对该基因的转录具有抑制作用,证实NKC基因在黄花烟草的钾吸收过程中起着重要作用.

关 键 词:黄花烟草  钾通道  转录  序列分析

Cloning and homology modeling of a potassium channel gene NKCl from Nicotiana rustica
GUO Zhao-kui,YANG Qian,YAN Pei-qiang,WAN Xiu-qing.Cloning and homology modeling of a potassium channel gene NKCl from Nicotiana rustica[J].Acta Tabacaria Sinica,2008,14(5).
Authors:GUO Zhao-kui  YANG Qian  YAN Pei-qiang  WAN Xiu-qing
Abstract:
Keywords:
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