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2株黄瓜花叶病毒卫星RNA的cDNA克隆及序列分析
引用本文:覃玥,陈集双,金波,廖乾生.2株黄瓜花叶病毒卫星RNA的cDNA克隆及序列分析[J].辽宁师范大学学报(自然科学版),2005,28(1):95-99.
作者姓名:覃玥  陈集双  金波  廖乾生
作者单位:河池学院,化生系,广西,宜州,546300;浙江大学,生命科学学院,浙江,杭州,310029;浙江大学,生命科学学院,浙江,杭州,310029
基金项目:国家自然科学基金资助项目(30270744)
摘    要:在辣椒上获得2株黄瓜花叶病毒卫星RNA(CS1和CS2),通过cDNA克隆和测序并将其与35个已知的卫星RNA序列进行同源比较.结果表明,CS1和CS2的全长序列分别为336,382nt;与CS2、Rs和Yns比较,CS1从第80位起有连续30多个核苷酸的缺失.由此推测,卫星RNA的二级结构也随这些核苷酸的缺失而发生了改变.将CMV卫星RNA分为4个组,卫星RNA CS1属于中小卫星组小卫星亚组Ⅱ,CS2属于长卫星组,CS1与其他来源的卫星RNA的同源性为80.4%~93.7%,CS2与其他来源的卫星RNA的同源性则为75%~94.8%;两之间的序列同源性为86%.CMV卫星RNA的序列同源性和分组与卫星RNA分布的地区和寄主来源并无直接联系.

关 键 词:黄瓜花叶病毒  卫星RNA  克隆  序列比较  同源性
文章编号:1000-1735(2005)01-0095-05
修稿时间:2004年12月31

Cloning and Sequence Analysis of Two Strains of Cucumber Mosaic Virus Satellite RNAs
Qin Yue,CHEN Ji-shuang,JIN Bo,LIAO Qian-sheng.Cloning and Sequence Analysis of Two Strains of Cucumber Mosaic Virus Satellite RNAs[J].Journal of Liaoning Normal University(Natural Science Edition),2005,28(1):95-99.
Authors:Qin Yue  CHEN Ji-shuang  JIN Bo  LIAO Qian-sheng
Abstract:
Keywords:cucumber mosaic virus  satellite RNA  cloning  sequence alignment  homogeneity
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