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基于模糊核判别分析的基因表达数据分析方法
引用本文:周晓彦,郑文明.基于模糊核判别分析的基因表达数据分析方法[J].华中科技大学学报(自然科学版),2007,35(Z1).
作者姓名:周晓彦  郑文明
作者单位:1. 南京信息工程大学,电子与信息工程学院,江苏,南京,210044;东南大学,学习科学研究中心,江苏,南京,210096
2. 东南大学,学习科学研究中心,江苏,南京,210096
基金项目:国家自然科学基金 , 江苏省自然科学基金 , 江苏省图像处理与图像通信重点实验室开放课题
摘    要:针对基因表达数据空间分布的特性,提出了一种基于模糊核判别分析的基因表达数据分析方法.方法综合了模糊数学以及核判别分析方法的优点,提高了对基因表达数据分类识别的准确性.以多发性骨髓瘤的基因表达数据为例进行了实验,从实验结果可以看出,采用模糊核判别分析方法可以得到最佳的识别效果.

关 键 词:模糊核判别分析  基因表达数据  生物信息学

Using fuzzy kernel discriminant analysis for tumor classification with gene expression data
Zhou Xiaoyan,Zheng Wenming.Using fuzzy kernel discriminant analysis for tumor classification with gene expression data[J].JOURNAL OF HUAZHONG UNIVERSITY OF SCIENCE AND TECHNOLOGY.NATURE SCIENCE,2007,35(Z1).
Authors:Zhou Xiaoyan  Zheng Wenming
Abstract:The use of gene expression data for recognition has been a very active research area in bioinformatics.In this paper,we proposed an effective gene expression data recognition method based on a fuzzy kernel discriminant analysis(FKDA),which is the nonlinear extension of fuzzy linear discriminant analysis(FLDA) via the kernel trick.Compared with the traditional kernel discriminant analysis(KDA) method,the proposed FKDA method is more powerful in terms of the generalization ability by providing a fuzzy grade for each training sample.We conduct experiments on the well-known acute leukemia dataset and the experimental results show that the proposed method can achieve the best performance among four commonly used recognition methods.
Keywords:kernel discriminant analysis  gene expression data  bioinformatics
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