| 环糊精二聚体的分子动力学模拟与自由能计算 |
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| 引用本文： | 孙婷婷,蔡文生,邵学广.环糊精二聚体的分子动力学模拟与自由能计算[J].中国科学B辑,2008,38(4):301-307. |
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| 作者姓名： | 孙婷婷 蔡文生 邵学广 |
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| 作者单位： | 南开大学化学系 天津300071 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金(批准号:20573102)，教育部博士点基金(批准号:20050055001)资助项目 |
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| 摘 要： | 采用分子动力学方法模拟了天然α，β，γ-环糊精（cyclodextrin，CD）二聚体以及6-O-（4-hydroxybenzoyl）-β-CD（HB-β-CD）二聚体在真空和水溶液环境下的结构和相互作用．利用自由能微扰方法计算了三种取向二聚体的结合自由能，以判断其稳定性差异．结果表明，在真空中由于分子间氢键作用，3种天然CD均以大口端．大口端为优势稳定取向，在溶液中三种天然CD二聚体平衡后的结构受到水的影响发生了很大的变化，且稳定性降低，而两个HB—β-CD形成的相互包结的二聚体的结构变化不大．自由能计算的结果表明，无论在真空还是溶液中，由于包结作用HB-β-CD二聚体的小口端-小口端为明显的优势取向，且稳定性要远远大于天然β-CD二聚体．
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| 关 键 词： | 环糊精二聚体 分子动力学 自由能微扰 |
| 收稿时间： | 2008-03-06 |
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