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西藏绒山羊KAP6.2基因SNPs位点的检测及分析
引用本文:周群,旦巴,富国文,王绍卿,吴玉江,索朗达,巴贵,次仁德吉,德吉,樊月圆. 西藏绒山羊KAP6.2基因SNPs位点的检测及分析[J]. 家畜生态学报, 2019, 40(7): 18-21
作者姓名:周群  旦巴  富国文  王绍卿  吴玉江  索朗达  巴贵  次仁德吉  德吉  樊月圆
作者单位:云南农业大学,云南昆明,650000;西藏阿里地区动物疫病预防控制中心,西藏阿里地区,859000;西藏自治区农牧科学院畜牧兽医研究所,西藏拉萨,850009
基金项目:现代农业产业技术体系建设专项;西藏科技厅十三五重大农业专项;西藏科技厅畜禽育种项目
摘    要:旨在研究绒毛品质相关基因KAP6.2在西藏绒山羊群体中的多态性,分析KAP6.2在不同山羊中的差异。采用聚合酶链反应-单链构象多态性和DNA测序等技术对随机选取的127只西藏绒山羊的 KAP6.2 基因进行突变位点检测及多态性指标分析。结果表明,西藏绒山羊 KAP6.2 基因存在两种基因型 AA和AB,其中等位基因A 为优势等位基因,多态信息含量为0.196 (属低度多态)。经测序并与GenBank中山羊KAP 6.2(No.AY316158)基因序列比对后共发现4处变异,分别为:178nt处24个碱基的缺失导致Ser48>Gly55氨基酸的丢失;113 nt处GT>CC突变导致氨基酸P.19Ser>Trp;121 nt处A>G突变为同义突变;168nt处C>T突变导致氨基酸P.41Thr>Tyr。这些氨基酸的突变很可能导致结构蛋白功能的改变,进而对西藏绒山羊的绒毛品质产生影响。通过研究影响西藏绒山羊绒毛品质的 KAP6.2 基因的多态性,深入了解其分子遗传基础,有利于利用分子遗传标记技术进行西藏绒山羊的选育。

关 键 词:西藏绒山羊  KAP6.2基因  SNPs位点  聚合酶链反应-单链构象多态性  DNA测序

SNPs Loci Detection and Analysis of KAP6.2 Gene in Tibetan Cashmere Goats
ZHOU Qun,Danba,FU Guowen,WANG Shaoqing,WU Yujiang,Suolangda,Bagui,Tsering Dekyi,Dekyi,FAN Yueyuan. SNPs Loci Detection and Analysis of KAP6.2 Gene in Tibetan Cashmere Goats[J]. Journal of Domestic Animal Ecology, 2019, 40(7): 18-21
Authors:ZHOU Qun  Danba  FU Guowen  WANG Shaoqing  WU Yujiang  Suolangda  Bagui  Tsering Dekyi  Dekyi  FAN Yueyuan
Affiliation:(Yunnan Agricultural University,Kunming,Yunnan,65000;Animal Blight Control and Prevention Center,Ngari Prefecture Tibet,859000;Animal Husbandry and Veterinary Institute of Tibet Autonomous Region,Lasa,Tibet,850009)
Abstract:ZHOU Qun;Danba;FU Guowen;WANG Shaoqing;WU Yujiang;Suolangda;Bagui;Tsering Dekyi;Dekyi;FAN Yueyuan(Yunnan Agricultural University,Kunming,Yunnan,65000;Animal Blight Control and Prevention Center,Ngari Prefecture Tibet,859000;Animal Husbandry and Veterinary Institute of Tibet Autonomous Region,Lasa,Tibet,850009)
Keywords:Tibetan Cashmere Goat  KAP6.2 Gene  SNPs sites  PCR-SSCP  DNA sequencing
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