| 醋酸水溶液局域结构中氢键环的感知与统计-CPMD模拟结果分析 |
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| 引用本文： | 蒲亮,缪强,徐红兰,章留留,张志炳.醋酸水溶液局域结构中氢键环的感知与统计-CPMD模拟结果分析[J].计算机与应用化学,2007,24(10):1324-1328. |
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| 作者姓名： | 蒲亮 缪强 徐红兰 章留留 张志炳 |
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| 作者单位： | 南京大学化学化工学院,江苏,南京,210093 |
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| 基金项目： | 致谢：我们感谢南京大学高性能计算中心提供SG13800和曙光3000服务器的免费计算机时. |
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| 摘 要： | 提出了用于分子动力学模拟后处理氢键网络图的感知算法。对从头算分子动力学(CPMD)模拟的轨迹文件进行统计分析,得到了水溶液中醋酸单分子水合体系的局域结构特征信息。由径向分布函数得到定义氢键的上限,运用图论方法分析了溶液结构中水合团簇大小和简单氢键环结构及头环分布,其中六元环的突出含量与从头算稳定性分析一致。
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| 关 键 词： | 分子动力学 氢键网络 氢键环 化学图 水溶液 醋酸 |
| 文章编号： | 1001-4160（2007）10-1324-1328 |
| 修稿时间： | 2007-03-16 |
Perception of hydrogen bonding ring in a local structure of aqueous solution in the CPMD simulation |
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| Pu Liang,Miao Qiang,Xu Honglan,Zhang Liuliu,Zhang Zhibing.Perception of hydrogen bonding ring in a local structure of aqueous solution in the CPMD simulation[J].Computers and Applied Chemistry,2007,24(10):1324-1328. |
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| Authors: | Pu Liang Miao Qiang Xu Honglan Zhang Liuliu Zhang Zhibing |
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| Affiliation: | School of Chemistry and Chemical Engineering, Nanjing University, Nanjing, 210093, Jiangsu, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | molecular dynamics hydrogen bond network hydrogen bond ring chemical graphics aqueous solution acetic acid |
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