| 一种新的DNA模体发现聚类求精算法 |
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| 引用本文： | 张懿璞.一种新的DNA模体发现聚类求精算法[J].西安电子科技大学学报,2014,41(6):95-99. |
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| 作者姓名： | 张懿璞 |
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| 作者单位： | (西安电子科技大学 计算机学院，陕西 西安710071) |
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| 基金项目： | 陕西省自然科学基金青年人才资助项目(2013JQ8037)；中央高校基本科研业务费专项资金资助项目(K5051303002) |
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| 摘 要： | 模体发现问题是分析基因转录调控关系的一个重要方面．提出了一种新的基于熵的聚类求精算法--ECRmotif，用于DNA序列中的模体发现问题．ECRmotif使用灵活的概率模型从背景序列中鉴别模体．它首先使用一个基于熵的聚类过程将数据集划分为若干子集，并对各候选子集压缩其实例的搜索空间，求精得到模体．通过模拟数据和真实数据的实验，表明ECRmotif算法可以有效地提高运行速度和效率，并准确地找出模体．
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| 关 键 词： | 模体发现 聚类 求精 |
| 收稿时间： | 2013-12-17 |
Novel cluster refinement algorithm for DNA motif discovery |
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| ZHANG Yipu.Novel cluster refinement algorithm for DNA motif discovery[J].Journal of Xidian University,2014,41(6):95-99. |
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| Authors: | ZHANG Yipu |
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| Affiliation: | (School of Computer Science and Technology, Xidian Univ., Xi'an 710071, China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | motif discovery cluster refinement |
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