| AsTP1的生物信息学分析及其细胞中的定位 |
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| 引用本文： | 吴顺华,谢谦,郑玉建,成军. AsTP1的生物信息学分析及其细胞中的定位[J]. 新疆医科大学学报, 2010, 33(12) |
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| 作者姓名： | 吴顺华 谢谦 郑玉建 成军 |
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| 作者单位： | 新疆医科大学公共卫生学院劳动卫生与环境卫生学教研室;新疆医科大学附属中医医院ICU;北京地坛医院; |
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| 基金项目： | 新疆维吾尔自治区自然科学基金，教育部博士点专项基金，教育部留学回国人员科研启动基金 |
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| 摘 要： | 目的 分析三氧化二砷反式激活基因1 (AsTP1)的结构及细胞定位.方法 采用生物信息学软件对AsTP1结构进行真核生物细胞定位预测;利用融合绿色荧光蛋白(greenfluorescent protein ,GFP)定位的方法,通过构建pEGFP-C1-AsTP1重组质粒,将重组质粒pEGFP-C1-AsTP1转染Jurkat T 细胞和HepG2细胞,在荧光显微镜下观察AsTP1蛋白的亚细胞定位.结果 生物信息学预测AsTP1蛋白为胞内定位,大多数定位在细胞核,部分在细胞质内.有2个可能的酪蛋白激酶II磷酸化位点分别在26 aa和38 aa;1个蛋白激酶C磷酸化位点在40 aa.荧光显微镜下观察发现,AsTP1蛋白主要定位在细胞核,在细胞质中也有表达.结论 初步明确了AsTP1的蛋白亚细胞定位,为进一步研究AsTP1基因的功能建立基础.
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| 关 键 词： | 三氧化二砷 AsTP1 绿色荧光蛋白 生物信息学 |
Bioinformatics analysis and cellular localization of AsTP1 |
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| WU Shun-hua,XIE Qian,ZHENG Yu-jian. Bioinformatics analysis and cellular localization of AsTP1[J]. Journal of Xinjiang Medical University, 2010, 33(12) |
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| Authors: | WU Shun-hua XIE Qian ZHENG Yu-jian |
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| Affiliation: | WU Shun-hua,XIE Qian,ZHENG Yu-jian(Department of Occupational and Environmental Health,College of Public Health,Xinjiang Medical University,Urumqi 830000,China) |
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| Abstract: | Objective To analyze the structure and cellular localization of AsTP1 transactivated by arsenic trioxide.Methods Several bioinformatics softwares were used to predict and analyze the structure.The recombinant plasmid pEGFP-C1-AsTP1 were transfected into Jurkat T or HepG2 cell lines and detected its subcellular localization were observed by fluorescent microscopy.Results Used the web service software-Proteomics and sequence analysis tools from Expasy,predicted the secondary structure and several physiochemic... |
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| Keywords: | Arsenic AsTP1 green fluorescent protein bioinformatics |
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