内生枯草芽孢杆菌HD-1β-甘露聚糖酶基因的克隆及结构生物学分析 |
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作者姓名: | 张建新 刘起丽 胡文波 聂国兴 韩科芳 赵杰 |
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作者单位: | 1. 河南师范大学水产学院,河南新乡,453007 2. 河南科技学院资源与环境学院,河南新乡,453003 |
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基金项目: | 河南省重点科技攻关项目(112102110118);河南省教育厅科技攻关项目(2010A180014) |
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摘 要: | 采用PCR技术从一株内生枯草芽孢杆菌HD-1基因组DNA中扩增出β-甘露聚糖酶基因核苷酸编码序列.序列分析表明,该基因全长1 089bp,编码362个氨基酸和一个终止密码子,N端前27个氨基酸为其信号肽.该酶氨基酸序列与相同来源的β-甘露糖苷酶同源性最高达98.34%,具有ManB保守结构域,属于糖苷水解酶家族26的一员.通过对该酶分子三维结构的预测分析,该酶的催化域形成TIM桶状结构,Cys92和Cys112形成二硫键,它们之间的部分构成该酶的氧化还原反应的活性中心,Glu100和Glu292分别为该酶的酸碱催化位点和亲核催化位点.三维结构的分析为提高酶的催化活性的和功能方面的定向改造提供了依据.
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关 键 词: | 内生 枯草芽孢杆菌 β-甘露聚糖酶 三维结构 |
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