| 长链非编码RNA在甲状腺乳头状癌中的表达谱分析 |
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| 引用本文： | 郭润生,王远强,史佩东,沈纳.长链非编码RNA在甲状腺乳头状癌中的表达谱分析[J].中华全科医学,2019,17(8):1408-1412. |
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| 作者姓名： | 郭润生 王远强 史佩东 沈纳 |
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| 作者单位： | 1. 上海健康医学院附属嘉定区中心医院普外科, 上海 201800; |
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| 基金项目： | 上海健康医学院师资人才百人库基金；上海市西医引导类科委课题(KW-201556302)；上海市浦江人才计划(18PJD004)；聚合物分子工程国家重点实验室(复旦大学)开放研究课题(K2018-08) |
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| 摘 要： | 目的长链非编码RNA(lncRNA)在肿瘤的发生和发展中起重要作用。本研究使用基因芯片技术筛选甲状腺乳头状癌中差异表达的lncRNA,并对这些lncRNA调控的靶基因进行预测和分析。方法本研究使用微阵列来研究3例甲状腺乳头状癌(PTC)和配对的邻近非癌性甲状腺组织中lncRNA的表达。基因功能通过GO(Gene Ontology,GO)和通路分析进行评估,并预测lncRNA潜在的靶基因。结果与邻近的非癌性甲状腺组织相比,共有855个差异表达lncRNA,上调195个,下调660个(FC>2,P<0.05);2370个差异表达mRNA,上调801个,下调1569个(FC>2,P<0.05)。其中差异较大的lncRNA有23个,mRNA有79个(FC>4)。lncRNA-SLC34A2和它相关的mRNA GRCh38(NM001177998)差异表达最为显著(FC=23.5)。差异表达的mRNA中显著富集的GO途径显示:一些与肿瘤有关,如"焦粘连""ECM-受体相互作用""MAPK信号传导途径"和"PI3K/AKT信号传导途径"。经过通路分析,42条信号通路在差异表达的转录后显著富集,其中"焦粘连"最为显著(P=8.499×10^-7)并与47个差异表达基因有关。239个与其相关mRNA的lncRNAs可能与顺式调控有关。lncRNAs和mRNAs的位点之间的相对位置关系在基因的不同位点。结论本研究是甲状腺肿瘤相关的LNCRNA谱的补充,发现了一定数量的差异表达的LNCRNA,并预测其功能靶向基因和途径。今后,笔者将选择更多的样本,深化对lncRNA分子机制和生化功能的研究,为甲状腺癌的早期诊断和治疗提供新的准确方法。
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| 关 键 词： | 甲状腺乳头状癌 lncRNA 微阵列 |
| 收稿时间： | 2018-06-15 |
Analysis of long non-coding RNA expression profile in papillary thyroid carcinoma |
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| Affiliation: | Department of General Surgery, Jiading Central Hospital, Shanghai 201800, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Papillary thyroid carcinoma lncRNA Microarray |
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