中国白梨PbSFBB13-gamma基因的分子克隆与序列特征 |
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引用本文: | 张琳,谭晓风,胡姣,乌云塔娜,袁德义,何小勇,龙洪旭,李秀根. 中国白梨PbSFBB13-gamma基因的分子克隆与序列特征[J]. 林业科学, 2009, 45(11) |
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作者姓名: | 张琳 谭晓风 胡姣 乌云塔娜 袁德义 何小勇 龙洪旭 李秀根 |
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作者单位: | 中南林业科技大学资源与环境学院,经济林育种与栽培国家林业局重点实验室,长沙,410004;浙江省丽水市科普工作指导站,丽水,323000;中国农业科学研究院郑州果树研究所,郑州,450009 |
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摘 要: | 以5个已知S基因型的中国白梨品种为试材,设计分别对应于梨SFBB-alpha,SFBB-beta和SFBB-gamma 基因的3对引物对这5个品种进行基因组PCR扩增.结果仅引物组合PSFBG-F/PSFBG-R从‘金花'(S_(13)S_(18)),‘金花四号'((S_(13)S_(18))和‘鹅梨'((S_(13)S_(34))中扩增出一约1 300 bp的条带,经回收、克隆、测序后,鉴定其为SFBB-gamma基因,命名为PbSFBB13-gamma(Pyrus bretschneideri SFBB13-gamma),GenBank登录号为EU081892.逆转录PCR结果表明PbSFBB13-gamma仅在花粉中特异表达;序列分析表明该基因不含内含子,编码区含1 191个核苷酸,编码396个氨基酸,预测分子质量与等电点分别为45.4 ku、4.63.PbSFBB13-gamma表现出典型的花粉SFB/SLF基因的基本结构特征,即1个F-box结构域及4个可变区;在推导氨基酸水平上,其与蔷薇科SFB/SLF基因的相似性为17.8%-97.7%.试验结果充分表明PbSFBB13-gamma应为花粉S基因的候选基因.选取蔷薇科34个SFB/SLF基因的全长氨基酸序列,构建进化树研究基因间的进化关系.结果表明,34个SFB/SLF基因形成2个亚科特异的类群,但不形成种特异的类群,其进化规律与蔷薇科S-RNase基因一致,即花粉SFB/SLF基因的形成也是在亚科形成之后、种形成之前.研究结果有助于从分子水平上揭示中国白梨的自交不亲和性机制.
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关 键 词: | 白梨 配子体自交不亲和性 花粉S基因 S位点F-box基因 进化树 |
Molecular Cloning and Characterization of PbSFBB 13 -gamma from Chinese White Pear (Pyrus bretschneideri) |
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Abstract: | |
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Keywords: | Chinese White Pear ( Pyrus bretschneideri) gametophytic self-incompatibility pollen S-gene S-locus-linked F-box gene phylogenetic tree |
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