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神经元图像大数据的弱监督自动识别技术
引用本文:黄港华,韩辉,郭健峰,李安安,骆清铭,肖驰.神经元图像大数据的弱监督自动识别技术[J].生命科学,2023(12):1570-1580.
作者姓名:黄港华  韩辉  郭健峰  李安安  骆清铭  肖驰
作者单位:1. 海南大学生物医学工程学院,海南省生物医学工程重点实验室;2. 华中科技大学武汉光电国家研究中心,Britton Chance生物医学光子学研究中心;3. 华中科技大学苏州脑空间信息研究院,中国医学科学院多模态跨尺度神经信号检测与成像创新单元
摘    要:在介观尺度上,小鼠大脑图像的数据量可达到10 TB量级,人脑数据量则达到惊人的几十PB,从海量脑图像数据中识别和分析神经元的形态是一项复杂且具有挑战的任务。当前研究人员提出了基于传统机器学习和深度学习的神经元识别算法,其中传统机器学习方法存在迁移、泛化能力较差的问题,基于深度学习的算法虽然可以通过海量精确标注的训练数据提高模型的泛化性,但缺乏精确且丰富的图像标记数据集,因此同样存在过拟合和泛化能力弱等问题。本文提出了一种基于深度学习的弱监督神经元识别方案,仅需要少量有标注的数据,即可通过迭代策略获取海量神经元图像的精确识别结果,具备较强的泛化能力,并最大限度减少人工参与量。该方法在fMOST、BigNeuron等数据集上进行了实验,自动识别精度F1值分别为0.9247和0.8318,优于其他对比的神经元识别算法。

关 键 词:弱监督学习  深度学习  神经元识别  迭代式学习
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