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无核葡萄VvWRKY20基因的克隆及其在胚珠败育过程中的差异表达分析
引用本文:李树秀,张朝红,巩培杰,杨堃,张旭彤,王跃进.无核葡萄VvWRKY20基因的克隆及其在胚珠败育过程中的差异表达分析[J].农业生物技术学报,2012,20(10):1143-1149.
作者姓名:李树秀  张朝红  巩培杰  杨堃  张旭彤  王跃进
作者单位:西北农林科技大学园艺学院旱区作物逆境生物学国家重点实验室/农业部西北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室,杨凌,712100
基金项目:国家自然科学基金项目(No.31171926);国家现代农业产业技术体系建设专项基金(No.CARS-30-yz-7);公益性行业(农业)科研专项经费(No.200903044)
摘    要:WRKY转录因子是植物特有的一类超家族转录因子,在植物的生长、发育和衰老过程中都有WRKY转录因子的参与.本研究利用SRAP-cDNA技术,以无核葡萄(Vitis vinifera)品种无核白胚珠各发育时期的cDNA为材料,克隆获得了311 bp的差异表达片段,进一步在有核葡萄(V.vinifera)品种黑比诺胚珠中进行验证.BLASTn分析表明,差异表达片段为葡萄基因组预测的WRKY20基因序列(XM_002272334.2)的部分序列.以序列XM 002272334.2为模版设计引物,通过RT-PCR技术在无核白胚珠cDNA中克隆到一个长1796 bp的同源序列,其ORF为1653 bp,编码550个氨基酸,命名为VvWRKY20(GenBank登录号:JQ782602).生物信息学分析表明,Vv WRKY20含两个WRKY保守结构域,两个C2H2锌指结构域,两个DNA结合位点,为WRKY家族中的Ⅰ类成员.其分子量为60140.4D,等电点为6.10,不稳定系数为51.01,属于不稳定蛋白.实时荧光定量PCR分析,该基因在无核白胚珠发育过程中表达量大且变化十分很明显,最大值与最小值之比为17.56,在有核品种黑比诺中,表达较低且表达水平保持相对稳定,最大值与最小值之比仅为2.52.在同一发育时期,该基因在无核白中的表达量也远高于在黑比诺葡萄中的表达量,10d时为15.77倍,30 d时达到229.12倍.有核与无核品种Vv WRKY20基因表达的差异表明,该基因可能参与无核葡萄胚珠败育.研究结果为进一步研究葡萄胚珠败育机制提供基础资料.

关 键 词:WRKY  胚珠败育  葡萄  相关序列扩增多态性(SRAP)  基因克隆  表达分析

Cloning and Expression Analysis of the Differentially Expressed VvWRKY20 Gene in the Development of Seedlessness Grape(Vitis vinifera) Ovule Abortion
LI Shu-Xiu , ZHANG Chao-Hong , GONG Pei-Jie , YANG Kun , ZHANG Xu-Tong , WANG Yue-Jin.Cloning and Expression Analysis of the Differentially Expressed VvWRKY20 Gene in the Development of Seedlessness Grape(Vitis vinifera) Ovule Abortion[J].Journal of Agricultural Biotechnology,2012,20(10):1143-1149.
Authors:LI Shu-Xiu  ZHANG Chao-Hong  GONG Pei-Jie  YANG Kun  ZHANG Xu-Tong  WANG Yue-Jin
Affiliation:Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultural Crops(Northwest Region), Ministry of Agriculture / Key Laboratory of Crop Stress Biology in Arid Areas, Colllege of Horticulture, Northwest Agriculture and Forestry University, Yangling 712100, China
Abstract:
Keywords:
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