| 辣椒GRAS家族全基因组鉴定与表达分析 |
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| 引用本文： | 张焕欣,董春娟,尚庆茂.辣椒GRAS家族全基因组鉴定与表达分析[J].园艺学报,2017,44(12):2305-2317. |
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| 作者姓名： | 张焕欣 董春娟 尚庆茂 |
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| 作者单位： | （中国农业科学院蔬菜花卉研究所，农业部园艺作物生物学与种质创制重点实验室，北京 100081） |
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| 摘 要： | 基于辣椒全基因组数据信息,利用生物信息学方法对CaGRAS基因家族进行了系统鉴定和进化分析,并通过Real-time PCR方法检测了CaGRAS家族组织表达模式和对PEG6000、盐胁迫的应答。结果表明:在辣椒中存在54个CaGRAS基因,除11号染色体外其余染色体均有分布,外显子数1~3,等电点4.97~9.13;系统进化分析显示CaGRAS基因可分为8个进化群;CaGRAS基因具有不同的表达模式,在根、茎、叶片和茎尖中优势表达的基因分别有34、8、3和8个;多数CaGRAS基因能响应PEG6000和盐胁迫,其中CaGRAS11、CaGRAS30、CaGRAS40、CaGRAS44和CaGRAS50受到PEG6000和盐胁迫的强烈诱导。本研究为深入解析CaGRAS家族基因的功能奠定了一定基础。
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| 关 键 词： | 辣椒 GRAS基因家族 进化分析 表达特性 |
Genome-wide Identification and Expression Analysis of GRAS Gene Family in Pepper |
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| ZHANG Huanxin,DONG Chunjuan,SHANG Qingmao.Genome-wide Identification and Expression Analysis of GRAS Gene Family in Pepper[J].Acta Horticulturae Sinica,2017,44(12):2305-2317. |
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| Authors: | ZHANG Huanxin DONG Chunjuan SHANG Qingmao |
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| Affiliation: | （Institute of Vegetables and Flowers，Chinese Academy of Agricultural Sciences，Key Laboratory of Biology and Genetic Improvement of Horticultural Crops，Ministry of Agriculture，Beijing 100081，China） |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | pepper GRAS gene family phylogeny analysis expression characteristic |
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