喜马拉雅旱獭组织分离的布鲁菌基因组生物学信息分析 |
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引用本文: | 薛红梅,赵志军,李积权,张雪飞,马丽,任玲玲,杨旭欣,王建玲,赵忠智,徐立青.喜马拉雅旱獭组织分离的布鲁菌基因组生物学信息分析[J].医学动物防制,2023(4):307-312. |
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作者姓名: | 薛红梅 赵志军 李积权 张雪飞 马丽 任玲玲 杨旭欣 王建玲 赵忠智 徐立青 |
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作者单位: | 青海省地方病预防控制所布鲁氏菌病预防控制科 |
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基金项目: | 国家自然科学基金(81860588); |
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摘 要: | 目的 了解喜马拉雅旱獭组织分离的1株羊种布鲁菌的基因组生物学信息。方法 应用新一代基因测序分析技术,对喜马拉雅旱獭组织分离出的菌株进行全基因组测序、组装和功能注释。结果 对获得分离菌株的全基因组概况和功能基因分析,从生物学信息角度挖掘喜马拉雅旱獭分离的布鲁菌关键生物学信息。此株羊种布鲁菌的基因组含3 301个基因,总长度为2 856 832bp,平均长度为847bp; GC含量约57.30%,占基因组全长的86.65%;主要内部基因1 021个,占全基因组的17.03%;插入序列350bp。结论 从全基因组水平分析喜马拉雅旱獭源性布鲁菌的基因组序列、编码基因和功能等,为了解该布鲁菌菌株的后续有关研究提供充足的数据支持,为喜马拉雅旱獭源性布鲁菌病感染提供参考。
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关 键 词: | 喜马拉雅旱獭 组织 分离的布鲁菌 基因组生物学信息 分析 |
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