雨生红球藻植物类型隐花色素基因克隆与序列分析 |
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作者姓名: | 杭伟 张宏江 马浩天 王晓丹 许文鑫 赵春超 李润植 崔红利 |
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作者单位: | 山西农业大学分子农业与生物能源研究所,山西 太谷 030801;山西农业大学分子农业与生物能源研究所,山西 太谷 030801;山西农业大学分子农业与生物能源研究所,山西 太谷 030801;山西农业大学分子农业与生物能源研究所,山西 太谷 030801;山西农业大学分子农业与生物能源研究所,山西 太谷 030801;山西农业大学分子农业与生物能源研究所,山西 太谷 030801;山西农业大学分子农业与生物能源研究所,山西 太谷 030801;山西农业大学分子农业与生物能源研究所,山西 太谷 030801 |
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基金项目: | 国家自然科学基金;基础研究项目;辽宁省科技计划;国家科技重大专项;山西省重点研发重点项目;山西农业大学科技创新项目;山西省研究生教育创新项目 |
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摘 要: | 为了从雨生红球藻中获得感知蓝光信号的植物类型隐花色素(CRY)序列,采用同源克隆和RACE相结合的方法获得了雨生红球藻编码植物类型Hae-P-CRY的c DNA全长,并对其序列进行生物信息学分析。结果表明,Hae-P-CRY基因的c DNA全长为3 608 bp,包含开放阅读框全长2 988 bp,编码995个氨基酸,预测等电点6.19,理论分子质量为107.7 ku。经Blast P分析发现,Hae-P-CRY氨基酸序列与莱茵衣藻来源植物类型Cre CRY氨基酸序列的相似性达到66.6%,与拟南芥CRY氨基酸序列相似性为46.94%。系统进化分析表明,Hae-P-CRY与其他真核绿藻来源的植物型CRY聚在一支,属于植物类型CRY。结构域分析表明,Hae-P-CRY基因含有光感知PHR结构域和信号转导CCT结构域,暗示具有感知和转导光信号功能。试验从雨生红球藻得到植物类型Hae-P-CRY基因序列,可为其表达、功能及互作蛋白研究奠定基础,同时为进一步解析雨生红球藻在蓝光响应中的分子机制奠定基础。
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关 键 词: | 雨生红球藻 隐花色素 基因克隆 生物信息学分析 |
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