| 最优特征子集预测蛋白质与蛋白质的相互作用 |
| |
| 引用本文： | 李占潮,戴宗,邹小勇.最优特征子集预测蛋白质与蛋白质的相互作用[J].化学研究与应用,2014(9):1483-1486. |
| |
| 作者姓名： | 李占潮 戴宗 邹小勇 |
| |
| 作者单位： | 1. 广东药学院医药化工学院,广东 中山,528458
2. 中山大学化学与化学工程学院,广东 广州,510275 |
| |
| 基金项目： | 国家自然科学基金项目，广东省自然科学基金项目，国家教育部博士点基金项目(20110171110014)资助。 |
| |
| 摘 要： | 蛋白质与蛋白质相互作用的识别有助于研究蛋白质功能和发现潜在的药物靶标。本研究采用氨基酸组成、二肽组成、三联子组成、组成、转变、分布和自相关特征对蛋白质与蛋白质相互作用对进行表征。基于最小冗余最大相关方法选择最优特征子集,结合支持向量机对酵母蛋白质与蛋白质相互作用进行了预测研究。通过采用最优特征子集,训练集和测试集的预测精度分别比二肽组成的提高了4%和2%,表明了当前方法的有效性。
|
| 关 键 词： | 蛋白质相互作用 最小冗余最大相关 支持向量机 |
Predicting protein-protein interactions based on the optimized feature subset |
| |
| LI Zhan-chao,DAI Zong,ZOU Xiao-yong.Predicting protein-protein interactions based on the optimized feature subset[J].Chemical Research and Application,2014(9):1483-1486. |
| |
| Authors: | LI Zhan-chao DAI Zong ZOU Xiao-yong |
| |
| Affiliation: | LI Zhan-chao;DAI Zong;ZOU Xiao-yong;School of Chemistry and Chemical Engineering,Guangdong Pharmaceutical University;School of Chemistry and Chemical Engineering,Sun Yat-Sen University; |
| |
| Abstract: | |
| |
| Keywords: | protein-protein interactions minimum redundancy maximum relevance support vector machine |
| 本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录！ |
