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奥利亚罗非鱼Piwi基因的克隆与生物信息学分析
作者姓名:肖俊  周毅  陈文治  钟欢  唐瞻杨  郭忠宝  罗永巨  甘西
作者单位:广西水产科学研究院,广西南宁530021
基金项目:国家自然科学基金(31260637); 广西科学研究与技术开发计划项目(桂科重14121004-1-2); 广西八桂学者建设工程专项经费; 广西大学博士后专项基金(20110490867)
摘    要:Piwi基因是影响鱼类生殖细胞发育的重要因子。通过设计特异引物,以奥利亚罗非鱼的精巢RNA为模板,通过PCR扩增和克隆测序,获得了两种基因序列,分别长2 571 bp和3 204 bp。通过生物信息学分析,表明这两个片段与尼罗罗非鱼的Piwil-1和Piwil-2相似性都达到99%。通过翻译,Piwil-1和Piwil-2的蛋白序列具有典型的PAZ和Piwi结构域。因此,这两个基因为奥利亚罗非鱼的Piwil-1和Piwil-2基因。另外,生物信息学分析也表明Piwil-1和Piwil-2在一级结构和二级结构上十分相似,说明在奥利亚罗非鱼基因组中这两个基因分化时间则较短。本研究为后续研究鱼类生殖机理和罗非鱼进化研究奠定了基础。

关 键 词:Piwi  奥利亚罗非鱼  克隆  生物信息学
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