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基于线粒体COⅠ和Cytb基因序列的北太平洋柔鱼种群遗传结构研究
作者姓名:刘连为  许强华  陈新军
作者单位:上海海洋大学海洋科学学院;上海海洋大学海洋科学学院;上海海洋大学海洋科学学院
基金项目:国家“八六三”高技术研究发展计划(2012AA092303); 国家自然科学基金项目(NSFC41276156); 教育部博士点基金(20093104110002)
摘    要:为准确掌握柔鱼的种群遗传结构,拟通过线粒体DNA的COI和Cytb基因序列分析方法对柔鱼不同产卵季节群体的遗传多样性和遗传结构进行研究。经PCR扩增与测序分别获得600 bp COI与481 bp Cytb基因序列。基于COI基因序列分析得到的单倍型数、单倍型多样性指数、核苷酸多样性指数及平均核苷酸差异数分别为24、(0.729 ±0.033)、(0.005 70 ± 0.003 25)和3.421。基于Cytb基因序列分析得到的单倍型数、单倍型多样性指数、核苷酸多样性指数及平均核苷酸差异数分别为28、(0.852 ± 0.016)、(0.006 45 ± 0.003 73)和3.101。分析认为, 北太平洋柔鱼2个产卵季节群体均具有较高的单倍型多样性指数和较低的核苷酸多样性指数。单倍型邻接树、两两群体间的Fst值以及AMOVA分析结果均表明, 北太平洋柔鱼2个产卵季节群体间的遗传差异不显著, 不存在显著的群体遗传结构。初步认为, 该海域因缺乏地理上的障碍, 加之北太平洋海流的作用以及柔鱼个体较强的游泳能力, 使得群体之间具有较强的基因流。

关 键 词:柔鱼   遗传多样性   遗传结构   细胞色素氧化还原酶I基因   细胞色素b基因
收稿时间:2012-01-18
修稿时间:2012-02-24
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