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基于生物信息学筛选影响胃癌患者预后的糖酵解相关基因
引用本文:赵旭辉,黄小敏,达德转,许焱,崔晓东,李红玲.基于生物信息学筛选影响胃癌患者预后的糖酵解相关基因[J].临床荟萃,2024(1):20-29.
作者姓名:赵旭辉  黄小敏  达德转  许焱  崔晓东  李红玲
作者单位:1. 甘肃中医药大学第一临床医学院;2. 甘肃省人民医院肿瘤内科
摘    要:目的 通过利用生物信息学开发糖酵解相关基因以预测胃癌(gastric cancer,GC)患者预后。方法 使用癌症基因组图谱数据库中GC患者信使核糖核酸表达谱数据,通过进行基因集富集分析以鉴定GC组织和正常组织间显著差异的基因集。通过最小绝对收缩和选择算子回归分析构建糖酵解相关基因预测GC患者预后的模型,并使用Kaplan-Meier分析、受试者工作特征曲线、单因素及多因素Cox回归分析验证模型预测性能。采用基因集变异分析分析高低风险组间生物途径状态的差异。结果 获得15个糖酵解相关基因(PFKFB2、UHRF1、ACYP1、CLDN9、STC1、EFNA3、NUP50、ADH4、ANGPTL4、PKP2、VCAN、HIF1A、LHX9、ANKZF1、ALDH3A2)与GC患者预后相关。根据15个基因特征风险评分,通过Cox回归分析将患者分为高风险组和低风险组。这15个基因标记是GC患者预后的独立生物标志物,低风险评分的GC患者预后更好。结合基因标记和临床预后因素的列线图可有效预测总生存期及无疾病生存期。结论 建立的15个糖酵解相关基因标记可作为预测GC患者预后的可靠工具,可能为GC提...

关 键 词:胃肿瘤  预后  预测模型  糖酵解
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