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基于数据库挖掘分析CKMT1A在非小细胞肺癌化疗耐药性中的作用
引用本文:江山,李辉,邓智霞,钱韬,严慧深.基于数据库挖掘分析CKMT1A在非小细胞肺癌化疗耐药性中的作用[J].中国现代应用药学,2021,38(11):1368-1373.
作者姓名:江山  李辉  邓智霞  钱韬  严慧深
作者单位:都江堰市人民医院呼吸与危重医学科, 成都 611830;扬州科技学院医学院, 江苏 扬州 225100
基金项目:江苏省高等学校自然科学面上项目(18KJD360003)
摘    要:目的 探讨线粒体肌酸激酶1A(creatine kinase mitochondrial 1A,CKMT1A)在非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)化疗耐药性中的作用。方法 通过HPA、GEPIA、GEO等数据库或在线分析工具分析CKMT1A在NSCLC及顺铂耐药性NSCLC细胞系的表达,运用非配对t检验分析组间差异;通过STRING结合DAVID 6.8分析CKMT1A互作基因的通路富集,运用Fisher Exact Test计算富集P值;microRNA.org结合Targetscan进行miRNA-mRNA互作分析进一步证明CKMT1A在NSCLC化疗耐药性中的作用;运用COREMINE工具进行文本挖掘分析显著富集的通路与NSCLC化疗耐药性的关系,以及microRNA与NSCLC化疗耐药性的关系;通过Kaplan Meier-plotter运用log-rank检验分析CKMT1A表达量、microRNA表达量与NSCLC患者总生存率(overall survival,OS)的相关性,以及CKMT1A表达量与NSCLC化疗患者OS的相关性。结果 CKMT1A在NSCLC患者及顺铂耐药性的NSCLC细胞系中的表达量显著升高(P=0.000),而且与患者的OS显著相关(P<0.05);代谢途径,尤其是精氨酸和脯氨酸代谢途径在CKMT1A互作基因中具有显著性富集(P<0.05),而且与NSCLC化疗耐药性密切相关;hsa-miR-103和hsa-miR-107靶向于CKMT1A,而且与NSCLC患者OS和化疗耐药性相关。结论 高表达CKMT1A影响NSCLC的预后及化疗耐药性,而且有可能通过精氨酸和脯氨酸代谢途径或者microRNA转录后调控介导NSCLC化疗耐药性。

关 键 词:线粒体肌酸激酶1A  非小细胞肺癌  化疗耐药性  数据挖掘
收稿时间:2020/5/30 0:00:00
修稿时间:2021/5/12 0:00:00

Analysis of the Role of CKMT1A on Non-small Cell Lung Cancer Chemotherapy Resistant Based on Data Mining
JIANG Shan,LI Hui,DENG Zhixi,QIAN Tao,YAN Huishen.Analysis of the Role of CKMT1A on Non-small Cell Lung Cancer Chemotherapy Resistant Based on Data Mining[J].The Chinese Journal of Modern Applied Pharmacy,2021,38(11):1368-1373.
Authors:JIANG Shan  LI Hui  DENG Zhixi  QIAN Tao  YAN Huishen
Affiliation:Department of Respiratory and Critical Care Medicine, Dujiangyan People''s Hospital, Chengdu 611830, China; School of Medicine, Yangzhou Polytechnic College, Yangzhou 225100, China
Abstract:
Keywords:creatine kinase mitochondrial(CKMT1A)  non-small cell lung cancer(NSCLC)  chemotherapy resistant  data mining
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