| 一种初步快速甄别总肠道病毒的基因分型方法 |
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| 引用本文： | 欧志英,吴韶清,尹应先,李丽霞,周荣,徐翼,龚四堂. 一种初步快速甄别总肠道病毒的基因分型方法[J]. 分子诊断与治疗杂志, 2016, 0(4). DOI: 10.3969/j.issn.1674-6929.2016.04.004 |
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| 作者姓名： | 欧志英 吴韶清 尹应先 李丽霞 周荣 徐翼 龚四堂 |
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| 作者单位： | 广州市妇女儿童医疗中心,广东,广州510623 |
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| 基金项目： | 广东省自然科学基金(S2012010009538;2016A030313501)，广州市妇女儿童医疗中心博士启动基金(2008031) |
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| 摘 要： | 目的 建立并验证总肠道病毒5’-非编码区(5＇-non coding region,5＇-NCR)PCR扩增测序并在NCBI数据库比对进行生物信息分析的方法,为手足口病的早期快速诊断提供敏感、高效的总肠道病毒分子分型检测方法. 方法 收集165例临床检测阳性的标本,提取总RNA扩增人肠道病毒A、B、C和D型5＇端非编码区用于总肠道病毒初步基因分型,PCR产物测序并在Genbank中进行BLAST分析.结果 成功从临床咽拭子标本中扩增了5＇-NCR用于基因分型.165例总肠道病毒阳性标本中鉴定出12种肠道病毒类型,有77例人肠道病毒(enterovirus type 71,EV-71),37例人柯萨奇病毒(coxsackievirus,CV)CV-A16,31例CV-A4,20例其它型别. 结论 5＇-NCR PCR测序是总肠道病毒基因分型和监测的敏感、简单、早期、快速的检测方法.
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| 关 键 词： | 手足口病 肠道病毒 分子流行病学 分子分型 |
A rapid genotyping assay for primary total enterovirus screening |
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