| 水稻条纹病毒山东济宁分离物RSV-SD-JN2分子变异分析 |
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| 引用本文： | 马进,宋云枝,李开东,朱常香,温孚江. 水稻条纹病毒山东济宁分离物RSV-SD-JN2分子变异分析[J]. 植物保护学报, 2008, 35(5): 415-420 |
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| 作者姓名： | 马进 宋云枝 李开东 朱常香 温孚江 |
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| 作者单位： | 1. 山东农业大学,作物生物学国家重点实验室,泰安,271018
2. 山东农业大学,作物生物学国家重点实验室,泰安,271018;山东农业大学生命科学学院,泰安,271018 |
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| 基金项目： | 国家高技术研究发展计划(863计划) |
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| 摘 要： | 为从分子水平探讨强致病性水稻条纹病毒山东济宁分离物RSV-SD-JN2的变异及其致病性,采用RT-PCR技术,克隆RSV-SD-JN2的RNA3、RNA4区段cDNA。结果显示,RSV-SD-JN2的RNA3和RNA4核苷酸序列长度分别为2487、2157bp;RNA3中,NS3基因长为636bp,基因间隔区(IR)为725bp,CP基因为969bp;RNA4中,SP基因长为537bp,基因间隔区(IR)为654bp,NSvc4基因为861bp。不同时期、不同区域和不同致病性的RSV分离物的序列比较发现,RNA3、RNA4序列5′和3′末端非编码区具有高度保守性,仅存在个别碱基的差异;基因编码区保守性较高,核苷酸和氨基酸序列同源性分别在93%和97%以上,且大部分碱基变异为无意义变异;基因间隔区(IR)易于变异。RSV的分子变异与其地理分布具有密切的关系。RNA4的IR的变异导致RNA二级结构——发夹结构的稳定性提高是病毒致病性增强的重要原因。
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| 关 键 词： | 水稻条纹病毒 序列分析 分子变异 |
| 收稿时间： | 2008-03-12 |
| 修稿时间： | 2008-03-12 |
The analysis of molecular variability of Rice stripe virus isolate |
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| Ma Jin,Song Yunzhi,Li Kaidong,Zhu Changxiang and Zhu Changxiang. The analysis of molecular variability of Rice stripe virus isolate[J]. Acta Phytophylacica Sinica, 2008, 35(5): 415-420 |
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| Authors: | Ma Jin Song Yunzhi Li Kaidong Zhu Changxiang Zhu Changxiang |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | RNA3 RNA4 |
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