水稻GATA基因家族生物信息学分析 |
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引用本文: | 骆鹰,王有成,王伟平,张超.水稻GATA基因家族生物信息学分析[J].分子植物育种,2018(17). |
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作者姓名: | 骆鹰 王有成 王伟平 张超 |
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作者单位: | 湖南科技学院化学与生物工程学院;湖南农业大学农学院;杂交水稻国家重点实验室湖南杂交水稻研究中心 |
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摘 要: | GATA基因家族是生物中一类重要的转录因子,在动植物生长发育、细胞分化以及植物响应环境变化中发挥重要作用。为揭示水稻中GATA家族特征及表达模式,利用生物信息学的方法对水稻GATA家族进行序列比对分析、保守结构域分析、蛋白三级结构分析以及GATA家族表达谱分析。本研究揭示了水稻GATA家族含有共同的GATA结合域,其蛋白三级结构整体相似性较高,组织中的表达水平呈丰富多样性,在激素应激中开启了不同的表达响应模式。这为进一步研究GATA基因家族成员的生物学功能提供参考依据,同时为水稻中其他基因家族研究提供指导。
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