| 重建代谢网络及其结构与功能的分析 |
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| 引用本文： | 丁德武,丁彦蕊,陆克中,须文波,黄海生.重建代谢网络及其结构与功能的分析[J].计算机与应用化学,2010,27(5). |
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| 作者姓名： | 丁德武 丁彦蕊 陆克中 须文波 黄海生 |
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| 作者单位： | 1. 池州学院数学与计算机科学系,安徽,池州,247000
2. 江南大学信息工程学院,江苏,无锡,214036 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目，安徽省教育厅自然科学基金资助项目，池州学院引进硕士研究生资助项目 |
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| 摘 要： | 文中研究重建代谢网络及分析其拓扑结构与功能.首先,详细介绍用于重建代谢网络的主要数据类型以及相关数据库.然后,介绍重建和精练代谢网络的方法,及重建苏云金芽胞杆菌(Bacillus thuringiensis)代谢网络的工作.用代谢物图表示该网络,共830个节点,1 132条连线.最后,分析网络的拓扑结构特征,借助代谢网络"蝴蝶结"结构的特征对其予以简化,并从网络的小世界效应、节点度分布和关键代谢物3方面分析其巨强连通体.该巨强连通体的平均路径长度为8.63,节点度分布符合幂律分布,表明它是一个典型的小世界和无标度网络.同时,研究结果表明其关键代谢物均具备重要的生物学功能意义.
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| 关 键 词： | 代谢网络 度分布 蝴蝶结 小世界 |
Reconstruction of metabolic network and its structural and functional analysis |
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| Ding Dewu,Ding Yanrui,Lu Kezhong,Xu Wenbo,Huang Haisheng.Reconstruction of metabolic network and its structural and functional analysis[J].Computers and Applied Chemistry,2010,27(5). |
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| Authors: | Ding Dewu Ding Yanrui Lu Kezhong Xu Wenbo Huang Haisheng |
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