西瓜果斑病菌T2SS分泌蛋白的筛选和功能预测 |
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引用本文: | 潘宏,高天一,吴明德,杨龙,张静,李国庆.西瓜果斑病菌T2SS分泌蛋白的筛选和功能预测[J].华中农业大学学报,2015,34(3):27-35. |
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作者姓名: | 潘宏 高天一 吴明德 杨龙 张静 李国庆 |
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作者单位: | 华中农业大学植物科学技术学院,武汉 430070;天津农学院图书馆,天津 300384;华中农业大学植物科学技术学院,武汉 430070;华中农业大学植物科学技术学院,武汉 430070;华中农业大学植物科学技术学院,武汉 430070;华中农业大学植物科学技术学院,武汉 430070;华中农业大学植物科学技术学院,武汉 430070 |
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基金项目: | 国家公益性行业(农业)科研专项(201003066) |
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摘 要: | 利用KEGG和STRING数据库分析比较瓜类果斑病菌(西瓜嗜酸菌)(Acidovorax citrulli,Ac)和主要植物病原细菌Ⅱ型分泌系统(T2SS)的基因组成,收集有试验证据的植物病原细菌T2SS分泌蛋白序列信息,与已测序并经注释的果斑病菌AAC00-1菌株基因组进行序列比对,筛选出候选的果斑病菌同源T2SS分泌蛋白。通过对筛选出的分泌蛋白的信号肽、代谢通路、蛋白互作网络及其在植物细胞中的定位进行分析,预测部分分泌蛋白的生物学功能。
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关 键 词: | 细菌性果斑病 瓜类果斑病菌(西瓜嗜酸菌) 分泌蛋白 筛选 功能 |
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