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西瓜果斑病菌T2SS分泌蛋白的筛选和功能预测
引用本文:潘宏,高天一,吴明德,杨龙,张静,李国庆.西瓜果斑病菌T2SS分泌蛋白的筛选和功能预测[J].华中农业大学学报,2015,34(3):27-35.
作者姓名:潘宏  高天一  吴明德  杨龙  张静  李国庆
作者单位:华中农业大学植物科学技术学院,武汉 430070;天津农学院图书馆,天津 300384;华中农业大学植物科学技术学院,武汉 430070;华中农业大学植物科学技术学院,武汉 430070;华中农业大学植物科学技术学院,武汉 430070;华中农业大学植物科学技术学院,武汉 430070;华中农业大学植物科学技术学院,武汉 430070
基金项目:国家公益性行业(农业)科研专项(201003066)
摘    要:利用KEGG和STRING数据库分析比较瓜类果斑病菌(西瓜嗜酸菌)(Acidovorax citrulli,Ac)和主要植物病原细菌Ⅱ型分泌系统(T2SS)的基因组成,收集有试验证据的植物病原细菌T2SS分泌蛋白序列信息,与已测序并经注释的果斑病菌AAC00-1菌株基因组进行序列比对,筛选出候选的果斑病菌同源T2SS分泌蛋白。通过对筛选出的分泌蛋白的信号肽、代谢通路、蛋白互作网络及其在植物细胞中的定位进行分析,预测部分分泌蛋白的生物学功能。

关 键 词:细菌性果斑病  瓜类果斑病菌(西瓜嗜酸菌)  分泌蛋白  筛选  功能
本文献已被 CNKI 等数据库收录!
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