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鸡毒支原体MG-HY株感染鸡气管的转录组学分析
引用本文:吴春琳,钟乐苗,赵妍,李文迹,黄晓紫,吴异健. 鸡毒支原体MG-HY株感染鸡气管的转录组学分析[J]. 畜牧兽医学报, 2022, 53(8): 2652-2662. DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2022.08.023
作者姓名:吴春琳  钟乐苗  赵妍  李文迹  黄晓紫  吴异健
作者单位:1. 福建农林大学动物科学学院, 福州 350002;2. 中西兽医结合与动物保健福建省高等学校重点实验室, 福州 350002;3. 福建省兽医中药与动物保健重点实验室, 福州 350002;4. 中科国创(南平)生物科技股份有限公司, 南平 354200
基金项目:福建省自然科学基金项目(2017 J01597);
摘    要:旨在进一步探究鸡毒支原体(MG)感染SPF雏鸡后气管基因组转录水平的变化,筛选出MG感染后参与气管黏膜炎性损伤的差异表达基因和调控通路。使用MG-HY株菌液按0.2 mL·羽-1经点眼滴鼻感染SPF雏鸡,感染后收集气管组织利用RNA-Seq技术进行测序分析。转录组分析结果显示,在MG感染期间RNA-seq共筛选出3 112个显著(P<0.01)差异表达基因(DEGs),其中,1 646个上调基因,1 466个下调基因。GO功能分析显示,差异基因主要涉及生物调节、刺激的反应、多细胞生物过程、细胞成分组织或生物发生等生物过程。KEGG-Pathway分析发现差异基因参与黏膜免疫信号传导通路,例如:细胞因子-细胞因子受体相互作用,细胞黏附分子(CAMs),细胞外基质(ECM)受体相互作用、紧密连接、PPAR信号通路和MAPK信号通路等,表明这些基因参与了MG诱导的雏鸡气管炎症反应和损伤。使用qRT-PCR验证与黏膜免疫相关的13个差异表达的基因,其结果与转录组分析一致。本研究为进一步阐明MG感染导致宿主气管黏膜上皮损伤和黏膜免疫机制提供了基础。

关 键 词:鸡毒支原体  RNA-seq  黏膜上皮  差异表达基因  免疫应答  
收稿时间:2021-12-01

Transcriptomic Analysis on Responses of Chicken Trachea to Mycoplasma gallisepticum Strain MG-HY Infection
WU Chunlin,ZHONG Lemiao,ZHAO Yan,LI Wenji,HUANG Xiaozi,WU Yijian. Transcriptomic Analysis on Responses of Chicken Trachea to Mycoplasma gallisepticum Strain MG-HY Infection[J]. Chinese Journal of Animal and Veterinary Sciences, 2022, 53(8): 2652-2662. DOI: 10.11843/j.issn.0366-6964.2022.08.023
Authors:WU Chunlin  ZHONG Lemiao  ZHAO Yan  LI Wenji  HUANG Xiaozi  WU Yijian
Affiliation:1. College of Animal Science, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou 350002, China;2. University Key Laboratory for Integrated Chinese Traditional and Western Veterinary Medicine and Animal Healthcare in Fujian Province, Fuzhou 350002, China;3. Fujian Key Laboratory of Traditional Chinese Veterinary Medicine and Animal Health, Fujian Agriculture And Forestry University, Fuzhou 350002, China;4. ZooKo Biochec Technology Co. Ltd, Nanping 354200, China
Abstract:
Keywords:Mycoplasma gallisepticum  RNA-seq  mucosal epithelium  differentially expressed gene  immune response  
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