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目的分析2009年肠道病毒71型广州分离株GZHY09的全基因组序列,并与GenBank中的序列进行分析比对。结论从GenBank上选不同地区的EV71全基因组序列,设计相互重叠的覆盖病毒整个基因组序列的12对引物,采用RT-PCR扩增出12个基因片段,通过测序获得全基因组序列,并参考国内外各EV71基因型的分离毒株,用MEGA4软件进行进化树分析,用DNAStar软件中的MegAlign进行同源性分析。结果 12个重叠基因片段序列拼接获得EV71全基因组序列,共7404个核苷酸,同源性分析结果表明在VP1区,GZHY09株与中国大陆的Anhui08、Zhejiang08、Shenzhen08的核苷酸序列同源性比较高,其中以Anhui08最高(97.7%)。结论 GZHY09属EV71病毒的C4亚型,与近年我国大陆地区流行的EV71株在进化上属于同一基因型,与Anhui08、Zhejiang08、Shenzhen08具有高度的同源性。 相似文献
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中国狂犬病毒疫苗株(5aG株)糖蛋白基因的克隆与序列分析 总被引:1,自引:0,他引:1
用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)方法从中国狂犬疫苗株(5aG株)病毒感染细胞中扩增得到该株病毒糖蛋白基因,并进行序列测定。结果表明该基因开放阅读框架全长1575bp,编码505个氨基酸的成熟糖蛋白及N-端19个氨基酸的信号肽,该基因与其他株系相应基因比较,核酸序列同源性为88%~91%,氨基酸序列同源性为87%~90%,其中膜外区同源性高于膜内区及跨膜区同源性。糖蛋白中重要功能区段嗜乙酰胆碱受体区段、抗原位点3等在个株系间高度保守。 相似文献
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目的比较2010年广州市分离到的甲型H1N1流感病毒血凝素(HA)基因和2009年中国大陆甲型H1N1流感病毒HA基因的变异情况,为甲型H1N1流感的监测和防控提供理论依据。方法收集2010年广州市有发热和呼吸道症状病人的咽拭子标本,用H1N1流感特异性引物进行PCR检测,扩增分离到的H1N1病毒HA片段,测序后与2009年的H1N1毒株进行比对和分析,并用生物信息学方法对抗原位点和糖基化位点进行分析。结果共收集到426份标本,甲型流感阳性211份,其中H1N1流感4株,与2009年分离的甲型H1N1流感相比,有12个氨基酸碱基位点发生了有意义突变,其中6个位点位于抗原位点上;4株毒株HA基因145位氨基酸都发生了变异;其中2株毒株在第180位氨基酸位点的抗原位点发生了变异。进化分析表明4株毒株与2009年中国大陆分离的8株毒株进化关系较远。结论 2010年广州市甲型H1N1毒株与2009年相比发生了较大变异。HA基因145位和180位氨基酸位点变异对H1N1毒株抗原变异有重要意义。本文分离的A/Guangdong/ZS03/2010(H1N1)和A/Guangdong/ZS01/2010(H1N1)毒株可能已经发生了抗原性漂移。 相似文献
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目的 研究细胞增殖上调因子(URGCP)在预测肝癌的预后和在肝癌的进展和发展中的潜在价值.方法 取材中山大学肿瘤医院病理科278例肝癌石蜡包埋标本,标本患者的手术日期在1995-2003年,在15个肝癌细胞株及10对肝癌与癌旁组织进行实时定量PCR和免疫印迹检测URGCP的表达.采用免疫组织化学检测278例肝癌样本,对URGCP表达进行分析,统计与临床数据的相关性,分析URGCP蛋白与肝癌患者预后的相关性.结果 免疫组化显示,URGCP在所有测试的肝癌细胞株及122例(43.8%)石蜡包埋肝癌标本中高表达.URGCP主要为胞质表达,随着肝癌级别的增高,URGCP的表达水平增高.URGCP的表达水平与临床分期显著正相关,与肝癌患者的预后生存显著负相关,与患者年龄、肿瘤个数、大小、AFP不相关.结论 URGCP在促进肝癌细胞增殖和肿瘤形成中起着重要的作用,并可能代表了一种新的预后标志物和治疗疾病的靶标. 相似文献
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目的了解广州地区临床分离的阴沟肠杆菌的耐药现状,以及质粒介导喹诺酮耐药(PMQR)基因qnrA,qnrB,qnrC,qnrS,qepA,aac(6’)-Ib-cr的流行情况。方法纸片扩散法进行药敏试验;PCR法扩增PMQR基因并将阳性产物测序分析;分析PMQR基因在环丙沙星(CIP)敏感及耐药株中的分布差异。结果 226株阴沟肠杆菌耐药率75%的药物有5种,其中CIP耐药率62.8%。63株(27.4%)检出PMQR基因,qnrA、qnrB、qnrS、aac(6’)-Ib-cr的检出率分别3.1%、7.5%、4.4%和15.0%,有5株存在两种PMQR基因,未检出qnrC和qepA基因。qnrA、qnrB、qnrS及aac(6’)-Ib-cr基因在CIP敏感株与耐药株中的分布经χ2检验,χ2分别为2.79,10.87,4.63和23.55,P分别>0.05、<0.01、<0.05及<0.01。结论本地区阴沟肠杆菌呈现多重耐药,qnrA、qnrB、qnrS及aac(6’)-Ib-cr基因在广州地区均有流行,且这几种基因与环丙沙星等药物的耐药率有一定相关性。 相似文献
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目的 了解血管内皮细胞生长因子 (vascularendothelialgrowthfactor,VEGF)可溶性受体sFlt 1联合内皮抑素 (Endostatin ,ES)基因治疗对甲状腺滤泡状癌细胞生长的影响 ,并探讨其作用机理。方法 2 0 0 1年 6月至 2 0 0 3年 12月 ,采用表达ES的肿瘤细胞系FTC133 rvEndo和表达sFlt 1的 2 93 Flt1 3d细胞行动物实验 ,观察肿瘤在裸鼠模型中的生长状况。用抗CD31抗体对肿瘤切片进行免疫组织化学染色检测微血管 ,计算微血管密度 (microvesseldensity ,MVD)。检测血清中ES和VEGF浓度。结果 在裸鼠模型中 ,种植 2 8d后 ,抑瘤率sFlt1组为 70 37% ,sFlt1 ES组为 93 4 9%。免疫组化染色表明对照组MVD为 (10 2 71± 13 14 ) ;而sFlt1组为(40 76± 12 6 5 ) ,sFlt1 ES组为 (13 71± 6 2 7) ,各组间差异有显著性 (P <0 0 5 )。对照组带瘤鼠血清中人VEGF浓度为 (31 2 5± 6 2 1) pg ,而sFlt1组为每毫升 (10 5 9± 0 72 ) pg ,sFlt1 ES组为每毫升 (7 4 5± 0 81) pg ,后两者与对照组间差异有显著性 (P <0 0 5 )。结论 sFlt1和ES的联合应用可增强其抗肿瘤血管生成和抗甲状腺滤泡状癌肿瘤生长的作用。其机理可能与VEGF的受抑制有关。 相似文献
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50年前Issacs和Lindenmann在研究病毒干扰时发现了干扰素。半个世纪以来,干扰素研究始终是现代分子生物学的一个前沿领域。对此,我们可以从几个方面来认识。首先,干扰素是第一个被发现的细胞因子,也是研究得最清楚的细胞因子之一。干扰素及其他细胞因子是高等动物体内的重要生物调节分子,有关干扰素及细胞因子的研究,长期是细胞与分子生物学的热点。 相似文献
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利用反转录多聚酶链反应(RT-PCR)技术分离并克隆了登革4型01株病毒的包膜蛋白(E)基因,并测定了部分核苷酸序列,发现该株与国外发表的一株相应区域核苷酸序列的同源性为93.4%,由此推测出氨基酸序列的同源性为92.1%。 相似文献