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FKBP12(FK506-binding proteins-12)是一种具有神经保护和促神经再生作用的蛋白.文中采用分子动力学模拟取样,运用MM-PBSA方法计算了FKBP12-TST复合物的绝对结合自由能.通过能量分解的方法考察了FKBP12分子主要残基与配体TST之间的相互作用. 相似文献
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该工作采用分子动力学模拟和主成分分析等方法研究了抑制剂SF2535、RVX08和RVXOH与BRD4蛋白第一结构域(BRD4-1)的结合对BRD4-1蛋白构象的影响.此外,为进一步研究三个抑制剂与BRD4-1蛋白的结合能力,采用分子力学泊松-玻尔兹曼表面积(MM-PBSA)方法计算了抑制剂与BRD4-1蛋白的结合自由能.结果表明SF2535与BRD4-1蛋白的结合能力最强.本研究不仅有助于更好的了解BRD4-1的功能和内在动力学,而且还可为以BRD4-1为靶标的有效抗癌药物的研发提供理论基础. 相似文献
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共轭帽分子分割法研究蛋白质的电荷密度 总被引:6,自引:6,他引:0
共轭帽分子分割(MFCC)法将蛋白质处理为一系列加了适当的共轭帽的单个的氨基酸片断,各片段的物理量可以用量化软件算出,整个蛋白质的物理量由各片段的物理量组合而得到.本文将加MFCC法应用于生物大分子的研究,得到了现在抗肿瘤研究中具有重要意义的p53蛋白的电荷密度和静电势. 相似文献
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D+CH4→CH3+HD反应的量子含时动力学研究 总被引:1,自引:0,他引:1
运用SVRT(semirigidvibratingrotortarget)模型[1 ] ,对反应D CH4 →CH3 HD进行了量子含时动力学研究 .计算结果表明 ,反应几率随平动能的变化曲线 ,呈现出显著的量子共振特性 .H -CH3的振动激发 ,极大地提高了反应几率 ,转动量子数j的增大 ,也会使反应几率有较大的提高 .结果表明 ,SVRT模型对于精确计算某些多原子分子间的反应碰撞 ,是十分有效的 相似文献
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