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目的:通过理论方法建立M2蛋白酶的三维结构模型。方法:基于模板进行多重序列联配和结构联配建立M2蛋白酶的初始结构模型,对初始模型进行分子力学和分子动力学优化,用多种评价方法对所得结构进行合理评价。结果:得到了M2蛋白酶的三维结构模型,合理性评价结果表明该结构模型正确,M2蛋白酶的催化活性位点与天冬氨酸蛋白酶相似,区别在于与活性位点相邻的结构域的构象不同。结构保守区α碳原子叠合结果说明M2蛋白酶与其他天冬氨酸蛋白酶具有相同的生物进化来源。结论:M2蛋白酶的结构模型可以为进一步的分子生物学实验提供有益的参考,也可以此模型为基础进行数据库筛选和药物分子设计。 相似文献
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雌激素受体和选择性雌激素受体调节剂的研究进展 总被引:5,自引:0,他引:5
雌激素受体属于核受体超家族成员,是一类重要的核转录因子,它在生殖系统、骨组织、心血管和中枢神经系统中发挥着重要的生理作用,是治疗骨质疏松和乳腺癌的重要药物作用靶标.已知的雌激素受体有α和β两种亚型,它们由两个不同的基因编码组成.选择性雌激素受体调节剂是一类在不同的组织细胞中对雌激素受体发挥不同调节作用的化合物,用于治疗绝经后妇女的骨质疏松和乳腺癌等.对近年来有关这两方面的研究情况进行综述. 相似文献
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3-哌啶甲酸和四氢烟酸的4,4-二芳基-3-丁烯衍生物的三维定量构效关系(比较分子力场分析)研究 总被引:1,自引:0,他引:1
目的研究3-哌啶甲酸和四氢烟酸的4,4-二芳基-3-丁烯衍生物结构和对γ-氨基丁酸摄取抑制活性之间的关系.方法使用三维定量构效关系(3D-QSAR)--比较分子场分析(CoMFA)方法进行构效关系研究.结果交叉验证系数q2和非交叉验证系数r2分别为0.726和0.986,方差比F为117.562,标准估计误差(SEE)为0.062.结论这些数值表明所得的CoMFA模型有实际意义,并且对3-哌啶甲酸和四氢烟酸的4,4-二芳基-3-丁烯衍生物抑制活性具有较好的预测能力. 相似文献
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目的:研究芬太尼类配体(FA)的溶剂化效应以及和μ阿片受体的相互作用机制。方法:将芬太尼类配体进行溶剂化,柔性对接到μOR的七个α螺旋束之内,计算结合能并进行CoMFA和QSAR研究。结果:(1)得到FA的溶剂化模型。(2)得到FA与μOR相互作用的模型,FA通过静电作用、氢键和疏水作用与μOR结合。(3)描述了μOR中适合于FA的结合口袋,主要位于μOR的第3,4,5,6,7跨膜螺旋中,形成口袋的主要残基为Ile144,Asp147,Tyr148,Met151,Trp192,Leu200,Ile238,Ile242,His297,Val300,Tyr326,Ser329。(4)FA-μOR的结合能与FA的镇痛活性之间有很好的相关性。结论:该研究有助于全面了解FA与μOR的相互作用机理和设计新的镇痛化合物。 相似文献
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