已上市中成药治疗肾阳虚证的“病-症-药”超网络分析及核心处方发现

目的 应用超网络法分析主治肾阳虚证的上市中成药,以期挖掘其临床应用、关键用药及核心处方,探寻中医药复方应用规律。方法 从中成药数据库和药智网中收集治疗肾阳虚证已上市中成药,在文献数据库中检索其临床研究,观察应用情况;以中成药涉及的疾病和症状及中药作为超网络的节点,采用Apriori算法对节点间关联规则进行分析,以相应支持度和置信度的关联组合作为超网络的边,构建肾阳虚证“病-症-药”超网络;使用Cytoscpe3.9.1软件进行网络可视化和拓扑分析,以药物超度值衡量网络中节点的重要性,由此挖掘肾阳虚证的主要疾病、核心处方和药物配伍规律。结果 筛选出191个复方,涉及药味293种,疾病43种,症状19种;其中64个复方有临床应用报道;肾阳虚证核心处方是鹿茸、肉苁蓉、淫羊藿、地黄、枸杞、人参、菟丝子、补骨脂、杜仲和附子,主要疾病是失眠和阳痿。结论 基于超网络筛选治疗肾阳虚证的核心处方,从多维度体现中医药异病同治思维,为临床诊疗与新药研发提供一定参考。     

基于网络药理学预测银杏蜜环口服溶液治疗冠心病与焦虑症的分子机制

目的:对银杏蜜环口服溶液进行网络药理学研究,探究其治疗冠心病与焦虑症的分子作用机制。方法:通过比较毒理基因组学数据库(Comparative Toxicogenomics Database,CTD)数据库获得银杏蜜环口服溶液有效成分和通过人类表型本体(HPO)数据库和Disease Connect数据库获得冠心病、焦虑症的靶点基因,运用STRING数据库,构建银杏蜜环口服溶液有效成分和冠心病,焦虑症的靶点基因网络。通过DAVID数据库综合比较分析,获得银杏蜜环口服溶液治疗冠心病,焦虑症的靶点基因的基因本体(Gene_Ontology,GO)功能和生物学通路。结果:银杏蜜环口服溶液的靶点基因网络有磷酸酶与张力蛋白同源物(PTEN),白细胞介素-10(IL-10),Smad3等32个基因,557个GO功能如生物质量调控、脂质稳态、睡眠的恒定机制等,20条京都基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)与冠心病重叠;有死骨片蛋白1(SQSTM1),超氧化物歧化酶1(SOD1),对氧磷酶1(PON1)等16个基因,260个GO功能如发育过程、细胞成分组织、声音的感官知觉等,10条KEGG通路与焦虑症重叠。经文献验证有10条通路和冠心病相关,4条通路与焦虑症有关。结论:银杏蜜环口服溶液可能通过干预MAPK信号通路同时对冠心病和焦虑症起到治疗效果。     

空间表达变异基因识别方法及其在肿瘤异质性 研究中的应用进展

空间表达变异基因的识别是阐明空间转录组学的基础。空间表达变异基因的分析需应用空间转录组数据相关公共存储库和计算技术。本文综述空间转录组学应用于空间表达变异基因识别的计算方法,阐述空间表达变异基因识别在肿瘤异质性研究中的应用进展,以进一步理解驱动肿瘤异质性发生发展的分子机制。     

基于网络靶点收敛算法预测治疗晚期肺腺癌的候选药物

目的：筛选晚期肺腺癌调控网络的收敛基因集,借助关联性图谱（CMap）预测治疗晚期肺腺癌的候选药物。方法：利用TCGA数据库检索肺腺癌转录组与临床数据,使用R4.0.3软件筛选肺腺癌早晚期患者的差异基因,使用Kaplan-Meier与log秩检验识别预后基因。DAVID和KEGG数据库对预后基因进行富集分析。依据背景网络构建差异预后基因调控网络,集体影响（CI）算法计算网络收敛基因集,将基因集导入CMap获得治疗晚期肺腺癌的候选药物,进一步对候选药物进行查找和分析。结果：共获得差异表达基因3409个,其中1981个与生存显著相关。富集分析结果显示,预后基因主要与细胞分裂、染色体分离、有丝分裂细胞周期、DNA复制、B细胞激活、T细胞激活等生物学过程相关;CI方法筛选得到晚期肺腺癌收敛预后基因96个,通过CMap连接图计算得到排名前20的候选化合物,其中,thapsigargin和nutlin-3通过文献验证对晚期肺腺癌有潜在的治疗作用。结论：借助生物信息学、网络靶点收敛算法和CMap数据库挖掘对晚期肺腺癌具有治疗作用的药物,为发现疾病的候选治疗靶点与药物开辟了新途径和思路。     

基于已上市中成药治疗气血两虚证的处方用药规律分析

目的探究已上市中成药治疗气血两虚证的处方及用药规律。方法收集已上市中成药,构成中成药数据库,筛选后得到治疗气血两虚证的中成药处方。应用古今医案云平台和Cytoscape 3.6.1对得到的中成药处方进行数据分析。结果得到中成药处方338种,数据分析。结果使用频次较高的药物有当归,熟地黄,黄芪,甘草,人参等。主要治法为益气养血,补气养血,益气补血,滋补肝肾等。提取出的基础方为四君子汤,当归补血汤,八珍汤。结论基于古今医案云平台对已上市中成药中治疗气血两虚证的中成药处方进行筛选分析,比较分析后发现用于治疗气血两虚证的药物中,不同中成药采用不同的药物配伍,但是黄芪,熟地黄,人参,当归等药物的配伍使用仍是较为核心的部分。同时在这些核心药物配伍的基础上依据不同临床表现,进行加减配伍,使在治疗气血两虚证的同时依据临床症状对症治疗。