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化学结构相似性检索在现代化学研究中具有重要作用。而化学结构的相似性度量是进行相似度检索的基础和前提。目前在化学信息学的研究中,有数量众多的化学结构距离度量和相似度表示方法。本文采用了Daylight的分子指纹方法,并采用了Tanimoto系数定义的相似度度量方法。并根据这种度量方法使用CDK来进行计算化学结构的相似度指数。在上述研究工作的基础上,开发了基于浏览器/服务器模式的化学结构相似度检索系统,通过该系统可以在中药活性成分数据库中进行化学结构相似度检索。用户在进行化学结构相似度检索时,可以选择已存在的化学结构,也可以采用JME来绘制新的化学结构。下一步将在该数据库中进行聚类分析和分子多样性的研究。 相似文献
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基于超图模型的空间数据挖掘 总被引:6,自引:0,他引:6
在空间数据挖掘中,知识表现为空间数据的内在结构以及不同数据子集之间的关系。可视化技术充分利用了图形和图像的表达能力以及人对于色彩和空间的敏锐的感知能力,使人机有机地融合在一起。该文基于超图理论提出了超图模型并将其用于空间数据挖掘。超图模型将超图理论、对象技术和可视化技术融合在一起,可用于表达复杂数据的内在结构和相互之间的关系,也表示对象的不同属性以及对象之间的关联程度。 相似文献
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基于BERT+BiLSTM+CRF的中文景点命名实体识别 总被引:1,自引:0,他引:1
为解决旅游文本在特征表示时的一词多义问题,针对旅游游记文本景点实体识别中景点别名的问题,研究了一种融合语言模型的中文景点实体识别模型.首先使用BERT语言模型进行文本特征提取获取字粒度向量矩阵,BiLSTM用于上下文信息的提取,同时结合CRF模型提取全局最优序列,最终得到景点命名实体.实验表明,提出的模型性能提升显著,在实际旅游领域内景点识别的测试中,与以往研究者方法比较下准确率,召回率分别提升了8.33%, 1.71%. 相似文献
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基于XML的设计模式描述和复用系统的研究 总被引:5,自引:0,他引:5
设计模式的描述、存储和检索是实现软件复用的关键技术。目前所采用的文档描述和存储方式十分不利于设计模式的有效利用。该文提出了基于XML的设计模式描述和复用系统(DPRU),给出了系统的总体结构并对其核心部分的实现进行了论述。DPRU系统充分利用了XML对于半结构化数据的描述能力以及关系型数据库技术的存储和检索特性,可实现分布式多用户环境下的设计模式检索和复用,同时也提供了多种应用扩展。 相似文献
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国电滦河发电厂总装机容量为300MW,其中6号、7号机组分别为l00MW,每台机组配置2台循环水泵,其出口阀门采用蝶阀,只有全开全闭2个位置,冷却水流量调节采用开泵台数进行控制。由于季节、负荷及昼夜温差的变化,时常会出现开1台流量不够,开2台流量过大的情况, 相似文献
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黑龙江各姐还田农利用从工立区进、京花种子迎巴西方圆,为全市用农解赢了发田农田生产的代由。由于乡年币场大米价,油月市许务者仲悄声回扩大问种面积,还有一些过去不种欢格的农民也闹钟点儿试试.日出汗发的地块大田a@足因过去工度不回直,江、货次不间没种次指.现在,农民想种又召在议@.河对雨水利局无烟农2所急,在节问6并任出工医技本人口50人实.目如风冒,瓦屋对西汗发的地块进6回亚,的问叙规,湖定工度建设方卖.巴时四级人力压的工队伍进行前工。使7大万苗农田田区及*n发的3万苗地快刀、排水工程开全力到了使用状态。昌0.… 相似文献
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作为高通量筛选的一种有效方法,虚拟筛选得到了越来越广泛的应用。当靶分子结构未知时,往往使用基于配体的虚拟筛选方法。在基于配体的虚拟筛选方法中,相似性方法起着非常重要的作用。基于中药有效成分化合物数据库,进行了层次凝聚聚类分析。在化学信息系统中,有许多的距离/相似性度量方法和相似性系数。在化学结构的表示和特征选择方面,使用了广泛使用的Daylight分子指纹。采用CDK项目来计算基于Daylight分子指纹的Tanimoto系数作为分子相似性度量方法。对TCM数据库进行了层次凝聚聚类分析,并在聚类之前应用了化学结构领域知识来进行待聚类数据的预处理。在层次聚类时,设定了0.75作为聚类的相似度阈值。计算了层次聚类过程中Kelly方法中的惩罚值来获取最合适的簇数量,通过该方法得到的簇数量与采用0.75作为相似度阈值聚类得到的簇数量非常接近。针对每一个包含多个化合物的簇,选取了多个化合物作为该簇的代表性化合物。同时根据聚类结果分析了Tanimoto系数的缺点。在后续工作中,可对TCM数据库进行分子骨架分析和多样性分析,并基于分子骨架进行聚类。 相似文献