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目的:观察PCR仪与测序仪在丙型肝炎病毒(HCV)基因型检测中的应用。方法:选择2018年1月~2018年12月收治的134例HCV感染患者为研究对象,给予患者PCR仪检测、测序仪检测。结果:测序仪检测134例均可分型,PCR仪检测130例患者可分型,4例未能分型。PCR检测结果:134例HCV感染患者中,1b型59例,2a型47例,3a型6例,3b型15例,6a型3例,4例为分出型别。基因测序结果:134例均可分型:1型59例,2a型40例,2i型7例,3a型6例,3b型15例,6a型3例,6n型4例。PCR仪检测法检测符合率97.0%。结论:PCR仪测序仪检测用于丙型肝炎病毒基因型检测,操作便捷,但其只能检测探针覆盖的型别,个别罕见型别不能分型。 相似文献
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苏云金芽孢杆菌与蜡状芽孢杆菌亲缘关系研究 总被引:3,自引:0,他引:3
目的探讨苏云金芽孢杆菌(Bt)与蜡状芽孢杆菌(Bc)的亲缘关系。为Bt鉴定、安全性评价及降低其致病风险等提供科学依据。方法采用肠杆菌基因间重复一致序列-PCR(ERIC-PCR)技术。对6株苏云金芽孢杆菌和3株蜡状芽孢杆菌及对照菌株的基因组DNA进行扩增,对其指纹图谱进行分析;回收并克隆重复性好的苏云金芽孢杆菌基因组DNA扩增片段,以其为探针,分别与供试菌株基因组DNA进行杂交。结果与蜡状芽孢杆菌相比,苏云金芽孢杆菌菌株间基因组DNA指纹图谱较一致;所有供试苏云金芽孢杆菌菌株均扩增产生一条250bp左右的片段;苏云金芽孢杆菌与蜡状芽孢杆菌均可扩增产生600bp左右的共有DNA片段。此外,以苏云金芽孢杆菌500bp片段为探针与苏云金芽孢杆菌基因组DNA杂交有很好的特异性。结论肠杆菌基因间重复一致序列-PCR指纹图谱可以正确反映苏云金芽孢杆菌与蜡状芽孢杆菌亲缘关系:500bD片段可以作为苏云金芽孢杆菌鉴定探针。 相似文献
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目的研究辽宁地区丙型肝炎病毒(HCV)基因分型特点,并分析其临床意义。方法选取100例丙型肝炎患者作为样本,首先采用聚合酶链式反应(PCR)-荧光探针法对丙型肝炎患者HCV基因分型进行测定,对PCR法分不出型别的样本,采用测序法检测,对HCV基因分型特点进行观察。结果辽宁地区100例HCV感染患者中,基因型包括1a型、1b型、2a型、3a型、3b型、6a型、6n型7种类型。上述类型中,1b型患者占比最高,1a型患者占比最低。各年龄段中,30~60岁患者各基因型占比更高。1b型、3b型患者,以男性居多;其他基因型患者,以女性居多。1a型患者感染途径以静脉吸毒为主,1b型患者可经血液、静脉吸毒、性传播、母婴传播等多种途径感染,各途径感染风险均较高。2a型患者,感染途径以输血、血制品等院内感染为主。3a型患者感染风险低,感染途径一般为静脉吸毒及性传播。3b型患者,经血液、静脉吸毒感染者居多。6a型及6n型患者,多为血液感染及静脉吸毒感染。结论辽宁地区HCV基因,以1b型基因为主,该基因型可经多种途径感染,临床应以之为重点,对HCV感染进行诊断以及治疗,抑制病情进展,改善患者的生活质量。 相似文献
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目的:研究测序仪对乙型肝炎病毒耐药突变基因的检测结果。方法:从2017年1月~2018年12月,本院收治的患者中选择连续服用拉米夫定、阿德福韦酯等核苷酸类药物2年以上,临床表现为病毒学突破,且HBVDNA>3×10~3IU/mL的慢乙肝患者中选取104例参与研究,进行乙肝病毒突变基因检测,分析突变位点,并对病毒进行基因分型。结果:研究组患者的104例慢性乙型肝炎血清当中,使用测序法进行检验有B型和C型两种基因型。两种基因型数量分别为11例和93例,所占比重分别为10.58%和89.42%。测序法能够检出12个突变位点,主要耐药的药物为拉米夫定。结论:测序仪能够很好的检验乙型肝炎病毒耐药突变基因。 相似文献
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