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目的:采用生物信息技术筛选与肝硬化铁死亡相关的差异表达基因,并预测具有潜在治疗作用的 中药及活性成分。方法:利用美国国立生物技术信息中心平台下的基因表达综合数据库(GEO) 收集肝硬化患 者基因表达数据集,应用R 软件对数据集进行差异化分析,获得肝硬化的差异表达基因集(DEGs);通过 FerrDb 数据库获得铁死亡相关基因(FRGs),采用蛋白质互作(PPI) 网络分析筛选核心基因,并进行基因本 体论(GO) 及京都基因与基因组百科全书(KEGG) 通路富集分析。通过Coremine Medical 数据库查找核心基 因对应的中药,通过检索中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP) 收集中药有效活性成分和筛选核心活性 成分;使用分子对接验证核心基因与核心活性成分的结合能力。结果:共筛选到与肝硬化铁死亡相关差异表达 基因67 个,参与了单体代谢过程、细胞对压力的反应、含磷化合物代谢过程等,涉及p53 信号通路、谷胱甘 肽代谢、FoxO 信号通路等,其中沉默信息调节因子1(SIRT1)、表皮生长因子受体(EGFR)、白细胞介素6(IL-6)、 过氧化物酶体增殖活化受体α(PPARα) 和核因子红细胞2 相关因子2(NFE2L2) 5 个核心基因均在铁死亡通 路中高度富集。TCMSP 预测得到丹参、枸杞子、黄芩和赤芍等17 种中药及β-谷甾醇、豆甾醇、槲皮素、山 柰酚4 种关键活性成分;分子对接显示,核心基因与关键活性成分结合良好。结论:丹参、枸杞子、黄芩和 赤芍等中药含有的β-谷甾醇、豆甾醇、槲皮素、山柰酚成分可以通过调控SIRT1、EGFR、IL-6、PPARα、 NFE2L2 等靶点来调控铁死亡治疗肝硬化。  相似文献   
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基于该装置本身,为了达到充分利用动物模型模拟体力活动不足状态的目的,设计一种改良式新型装置,延长原有实验时间,拓展装置功能,同时方便新型实验的进行。“体力活动不足大鼠尾部悬吊装置(tail-suspended,TS)”模拟人体状态以便较准确的模拟体力活动不足的状态。本文就现有大鼠尾部悬吊装置做出改进并予以说明,对于新型装置的优点及实验应用的全面性开展相关综述。  相似文献   
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