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隐马尔可夫模型是对DNA序列建模的一种简单且有效的模型, 实际应用中通常采用一阶隐马尔可夫模型. 然而, 由于其一阶无后效性的特点, 一阶隐马尔科夫模型无法表示非相邻碱基间的依赖关系, 从而导致序列中一些有用统计特征的丢失. 本文在分析DNA序列特有的生物学构造的基础上, 提出一种用于DNA序列分类的二阶隐马尔可夫模型, 该模型继承了一阶隐马尔可夫模型的优点, 充分表达了蕴涵在DNA序列中的生物学统计特征, 使得新模型具有明确的生物学意义. 基于新模型, 提出一种DNA序列的贝叶斯分类新方法, 并在实际DNA序列上进行了实验验证. 实验结果表明, 由于二阶隐马尔可夫模型充分反映了DNA序列碱基间的结构信息, 新方法有效地提高了序列的分类精度. 相似文献
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基于隐马尔科夫模型的DNA序列分类方法 总被引:1,自引:0,他引:1
DNA序列分类是生物信息学的一项基础任务,目的是根据结构或功能的相似性预测DNA序列所属的类别。为进行有效分类,如何将序列映射到特征向量空间并最大程度地保留序列中蕴含的碱基间顺序关系是一项困难的任务。为克服现有方法容易导致因DNA序列碱基残缺而影响分类精度等问题,提出一种新的DNA序列特征表示方法。新方法首先为每条序列训练一个隐马尔科夫模型(HMM),然后将DNA序列投影到由HMM状态转移概率矩阵的特征向量构成的向量空间中。基于这种新的特征表示法,构造了一种 K-NN分类器对DNA序列进行分类。实验结果表明,新型特征表示方法可以较为完整地保留 DNA 序列中不同碱基间的关系,充分反映序列的结构信息,从而有效提高了序列的分类精度。 相似文献
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采用回声测深的时间逼近法,分析了声速修正测深的原理,编制了计算程序,并在小浪底水库大断面淤积测量中得到应用。 相似文献
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采用传统高温固相法制备了KCaM(PO4)2:Dy3+(M=La,Y,Lu)荧光粉。X射线衍射表明,KCaM(PO4)2:Dy3+(M=La,Y,Lu)荧光粉属于六方晶系,P6222空间点群;随着金属阳离子M离子半径的增大,衍射峰向小角度方向移动。低温下的KCaM(PO4)2:Dy3+(M=La,Y,Lu)荧光光谱表明:同一基质中Dy3+在不同波长光激发下,发射峰发生了改变。金属阳离子M在晶体中存在2种格位(发光中心),在不同金属阳离子M的基质中,用相同光激发时,发射光谱明显不同。金属阳离子M的改变引起周围晶体场的改变,从而改变2种格位在不同基质中所占有的比例。因此,可以把Dy3+作为探针来研究晶体结构的变化。 相似文献
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乙烯裂解气压缩机在乙烯装置中的作用是将裂解炉的裂解气压缩升压、送人分离系统,并在压缩过程中除掉裂解气中夹带的水分,因此它的运转好坏直接影响装置的正常生产,是乙烯生产的关键部位。在实际生产中,乙烯裂解气压缩机极容易结垢,导致转子的不平衡,负荷降低轴振动的振幅增大,排出的温度升高,能使压缩机后段效率下降高达20%,工厂的能耗将相应增加,严重影响压缩机的检修周期和乙烯装置的长周期运行。因此,为了从根本降低垢的形成,研究结垢的化学组成非常重要。 相似文献
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