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【目的】筛选与马铃薯主茎数和单株结薯数显著关联的单核苷酸多态性(SNP)位点并挖掘候选基因,为高产马铃薯分子育种提供基因资源。【方法】以251份马铃薯核心种质为材料,于2018-2019年在马铃薯主产区4个试验点共8个环境下对其主茎数和单株结薯数进行表型鉴定;提取251份马铃薯种质的DNA,并采用高通量IlluminaHiSeqTM对DNA进行测序及处理,获得高质量SNP标记,在此基础上,结合表型性状进行全基因组关联(GWAS)分析,对显著关联的SNP位点所在区域的候选基因通过NR、Swiss-port、KEGG、GO等4个数据库进行功能注释。【结果】2018-2019年的检测结果表明,在环境和基因型互作下,251份马铃薯种质间主茎数与单株结薯数有广泛的表型变异。共获得1 209 969个高质量SNP位点,其中与主茎数显著关联的SNP位点有7个,共挖掘到19个候选基因,其中在3个以上环境重叠的候选基因有9个,其可能编码半乳糖醛酸转移酶、转录因子MYB、赤霉素3-β-双加氧酶及细胞色素P450;与单株结薯数显著关联的SNP位点有13个,共挖掘到33个候选基因,去掉2年间重叠的4个候选基因,实际共关联到29个候选基因,其中在3个以上环境下重叠的候选基因有11个,其可能编码果糖-1,6-二磷酸醛缩酶、生长素响应因子IAA13、转录因子WRKY、bHLH113及MADS-box。【结论】在2年8个环境下共鉴定出20个与马铃薯主茎数和单株结薯数显著相关的SNP位点,挖掘到48个候选基因。 相似文献
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旨在利用长纯合片段(runs of homozygosity,ROH)信息评估不同绵羊群体的近交情况,并鉴定与绵羊经济性状相关的基因。本研究基于Illumina Ovine SNP50芯片对来自10个绵羊群体共440个个体进行全基因组ROH检测,统计ROH在不同绵羊群体中的数目、长度及频率,根据ROH计算基因组近交系数(F_(ROH)),并对高频ROH区域进行基因注释。结果,在10个绵羊群体中共检测到25 920个ROH片段,不同绵羊群体ROH的数目、长度、频率及分布存在明显差异。ROH平均数目的变化范围从10.17个(苏尼特羊)到95.99个(杜泊羊),平均长度的变化范围从2.04 Mb(四川藏羊)到4.71 Mb(罗布羊),平均F_(ROH)的变化范围从0.010(苏尼特羊)到0.172(杜泊羊)。引进品种的(杜泊羊和德美羊)平均F_(ROH)明显高于地方品种。在地方绵羊群体中,西藏藏羊(0.085)具有最高的平均F_(ROH)。在高频ROH区域鉴定到26个与绵羊经济性状相关的基因,如与生长发育相关的基因NCAPG、LCORL、PRKAA2、FAIM2和HYDIN,与脂肪代谢相关的基因LEPR、WNT10B和NCKAP5L,与肉质及胴体性状相关的基因CDIPT、CAPN3和FGF9。基于ROH评估的近交情况可为绵羊种群育种和保种提供参考依据,鉴定到的候选基因可以作为绵羊标记辅助选择重要的基因。 相似文献
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初果期苹果树剪枝仿真研究 总被引:2,自引:0,他引:2
苹果树的剪枝对果树坐果和树形塑造起着重要的作用。本文选用五年生苹果树为研究对象,对其进行仿真研究。首先,采用三维激光扫描仪对冬季落叶后的果树进行扫描获取点云数据,经过去噪、重采样和软件处理获得苹果树的骨架节点。其次,再对苹果树进行4种不同类型的剪枝处理,经过一个生长期后,记录被修剪枝条的生长数据,进行定性和定量分析。分析结果表明,随着果树修剪的加重,潜伏芽率、短枝率会逐渐下降,中枝率变化不显著,但长枝率会逐渐增加。根据每种修剪类型后对应母枝的抽枝类型与母枝上的节位规律变化,生成了对应的多项式拟合函数,为虚拟苹果树修剪仿真提供数学规律。最后,建立了苹果树修剪仿真软件用于初果期苹果树剪枝仿真,修剪后仿真抽枝结果的变化规律与实际修剪产生的抽枝规律相符,可为初果期苹果树来年坐果或塑形提供修剪参考方案。 相似文献
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旨在监测湖北省生猪屠宰场中伪狂犬病病毒(pseudorabies virus, PRV)的流行情况。采集2020—2022年湖北省4个区域(鄂东、鄂北、鄂西、鄂中)共9个县市不同规模屠宰场的1 795份血液样品和2 081份肺样品(肺、肺门淋巴结),分别使用靶向PRV gE基因的ELISA和PCR方法检测血清中的抗体和肺样品中的病原,同时对阳性样品进行病原分离鉴定、全基因组测序和遗传进化分析。血清学检测结果显示,共有104份样品为阳性,平均阳性检出率为5.79%。病原学检测结果显示,共有82份样品为阳性,平均阳性检出率为3.94%。按不同因素对检出率进行分析,显示抗体和病原都在春季检出率最高,分别为18.57%和9.74%;湖北省东部的抗体检出率最高(10.77%),中部的病原检出率最高(4.93%);A类小型屠宰场的病原和抗体检出率都显著高于其他3个类型,分别为16.28%和6.01%。从病原阳性样品中共分离到PRV 17株,经全基因组和gB、gC、gE基因遗传进化分析结果显示均属于基因Ⅱ型变异株,与Bartha、NIA-3、Becker等早期国外分离株处于不同的遗传进化分支。其中H... 相似文献
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水产品加工厂设计中HACCP原理的应用 总被引:1,自引:0,他引:1
水产品加工厂作为水产品加工的主要场地,为了保证水产品的加工质量,其场地的良好设计能够在促成产品优良品质上起到了不可估量的作用。危害分析及关键控制点(Hazard Analysis and Critical Control Point,简称HACCP)程序即为生产安全可靠的食品而采取的一种先进的预防措施。HACCP原理在目前食品加工行业中应用广泛,特别是在加工过程中的应用。在水产品加工厂设计阶段,如果能利用HACCP原理进行卫生优化设计,将避免发生(以往经常发生的)加工厂在交付使用后因不符合卫生要求而进行大幅度的拆改、调 相似文献
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基于产业链的视角,构建了一套钢铁产业国际竞争力评价方法,分析了1995年以来中国钢铁产业国际竞争力的变迁,并进行了国际比较.结果表明:在样本期间内,中国钢铁产业国际竞争力增强趋势明显,但在不同阶段引起钢铁产业国际竞争力提升的因素差异较大中国钢铁产业国际竞争力低于德国、美国、意大利和日本等发达国家,高于巴西与印度尼西亚等发展中国家中国钢铁产业能源效率较低,对能源的依赖明显高于发达国家,中国等发展中国家服务业对钢铁产业的国内供给能力普遍低于美国等发达国家;中国服务业对钢铁产业支撑作用下降,能源产业支撑作用微弱上升中国国内产业需求对钢铁产业的支撑作用收敛于发达国家,且发展中国家的建筑业需求贡献度较大. 相似文献
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文章以世界十大钢铁生产大国作为研究对象,分别测算了这些国家1996年至2006年钢铁产业链各环节的国际市场占有率和贸易竞争力指数。研究结果显示,中国钢铁产业在国际市场的占有率稳步提高,但中国钢铁产业的贸易竞争力仍然很弱;俄罗斯钢铁产业受上游产业能源与资源的束缚最少;而中国、日本、韩国、德国和意大利严重受到上游产业的制约,印度、巴西、乌克兰和俄罗斯钢铁产业链下游产业的贸易竞争力普遍较弱,而日本、德国和意大利的则普遍较强。 相似文献
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为明确4个低氢氰酸含量的高丹草新品系SLCN 11、SLCN 12、SLCN 13、SLCN 14及其亲本散穗高粱、黑壳苏丹草、白壳苏丹草、红壳苏丹草和棕壳苏丹草在DNA 水平上的差异程度,以育成登记的高丹草品种蒙农青饲3号为对照,对其进行了SSR 分析。试验从200个高粱SSR 引物中筛选出多态性丰富、重复性好的12对引物,利用这些引物对10个材料进行PCR 扩增共得到509个多态性位点,多态性百分率达87.30%。每对引物扩增的SSR指纹图清晰、稳定,可作为鉴别4个高丹草新品系及其亲本的分子依据。10个供试材料间的遗传距离(GD)变幅在0.3165~0.6692之间,平均为0.5359;以GD 值0.50为基准,将10个材料划分为5类:蒙农青饲3号、散穗高粱、LCN-11、SLCN-12、SLCN-13为一类;SLCN-14、棕壳苏丹草为一类;白壳苏丹草、黑壳苏丹草、红壳苏丹草各单独为一类。该研究为下一步低氢氰酸含量高丹草新品种育成及登记利用奠定了基础。 相似文献
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采用SRAP标记对收集的24份彩色马铃薯种质资源遗传多样性进行分析,探讨其遗传多样性及种质间亲缘关系,以期为彩色马铃薯种质资源高效利用及新品种选育奠定基础。结果表明,14对SRAP多态性引物共检测到74个多态性位点,多态性信息量(PIC)均值为0.87,有效等位基因数(Ne)均值为1.61,Nei’s遗传多样度(H)均值为0.36,Shannon信息指数(I)均值为0.54。24份彩色马铃薯种质间遗传相似系数介于0.45~0.78之间,均值为0.61,表明供试海雀稗种质间存在较大遗传差异。聚类分析显示,当GS=0.61时24份彩色马铃薯种质被划分为四大类群。主成分分析发现,Ⅲ、Ⅳ类群间有重叠现象,说明它们之间亲缘关系较近。24份彩色马铃薯种质具有较丰富的遗传多样性,可通过进一步研究应用于新品种选育。 相似文献