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DNA基因芯片在中华骨髓库HLA组织配型检测中的应用价值 总被引:7,自引:0,他引:7
目的应用DNA基因芯片对中华骨髓库造血干细胞捐献者血样进行HLA—A、B、DR分型检测,探讨基因芯片应用于中华骨髓库建库的可行性。方法常规提取血样DNA,用国际通用的方法合成PER引物,对A、B、DR位点进行PCR扩增,电泳检测合格的扩增产物经纯化、点片、固定制成DNA芯片,用荧光标记探针杂交,激光扫描提取数据,专用软件进行分析。结果共得到2000份分型结果,用目前建库常用的分型试剂对4%随机抽样复核,符合率100%;进行基因频率统计分析,结果与以往资料报告接近。结论HLA基因芯片是一项拥有中国自主知识产权的新技术,高通量、规范化、低价格是其显著优点,比较适合大规模集中化检测的实验室使用。 相似文献
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弱RhCe型家系调查 总被引:5,自引:0,他引:5
目的 了解弱RhCe抗原遗传背景。方法 采用红细胞凝集试验检测先证者父母和兄弟姐妹的RhD、C、c、E、e抗原 ,用PCR SSP方法检测RH基因。观察Rh血型基因的构成和抗原表达情况。结果 父亲带有弱RhCe抗原和正常的RhcE抗原 ,基因型为RHCe/RHcE ;母亲有正常RhCe抗原 ,基因型为RHCe/RHCe ;先证者有与父亲相同的弱RhCe抗原 ,基因型为RHCe/RHCe ;哥哥和弟弟都仅有RhcE抗原 ,基因型为RHcE/RHCe ;姐姐有正常的RhcE和RhCe抗原 ,基因型为RHcE/RHCe。结论 我国人群中RHCE基因存在有无效的RHCe基因和弱RHCe等位基因。 相似文献
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目的观察河南汉族精神分裂症患者HLA-A、B和DRB1位点基因频率分布情况。方法对277名精神分裂症患者提取人类基因组DNA,采用聚合酶链反应-序列特异性寡核苷酸探针技术进行HLA-A、B、DRB1基因分型,计算基因频率,与河南汉族正常人群HLA基因进行频率比较。结果分别检出HLA-A、B、DRB1基因14个、32个和13个,基因频率分布情况与河南汉族正常人群基本一致,两组人群中常见基因的频率进行比较发现B58和DR13的差异具有统计学意义(P〈0.05)。结论河南汉族精神分裂症患者HLA基因频率分布符合河南汉族正常人群的分布特征,HLA-B58和DR13频率分布差异具有显著性。 相似文献
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目的 建立献血者HCV核酸荧光定量检测方法。方法 按卫生部规定对机采献血者进行初复检合格后,再用荧光定量PCR进行核酸检测,对结果进行分析。结果 经过酶免试验剂检测合格的准备献血者245人再用荧光定量PCR检测核酸,发现一例阳性,结论 PCR核酸检测检测有较高的灵敏度,而且实时荧光定量PCR检测有诸多优越性。 相似文献
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血站检验科所进行的酶免实验有其特殊性 :标本量大、检测集中、项目固定。卫生部规定的酶免检测项目有HBsAg、抗 HCV、抗 HIV、抗 TP(梅毒酶免检测 )等 ,要用不同厂家的试剂进行初、复检实验。采用全自动酶免分析检测系统后对试剂又有了新的要求 ,笔者所在的实验室采用试剂招标的方法进行试剂选择 ,做法如下。1 成立试剂选择 (招标 )组织在有关人员的主持下组成由相关部门参加的试剂招标办公室 ,负责收集曾用过的试剂厂家的有关资料、向其他厂家发出邀请、并负责收集整理厂家寄回的资料。负责对厂家的合格身份进行审核 ,拟订… 相似文献
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目的:由于技术原理的限制,目前尚不能对所有的HLA等位基因进行严格的区分,特别是以往没有发现的新基因序列只能通过测序的方法解决,然而,当遇到等位基因杂合时,测序给出的结果仍然无法确认新的序列改变发生在等位基因的哪一侧,这时需要用分子生物学方法分离杂合子然后进行测序才能确定新的基因序列。采用基因克隆方法确认HLA新等位基因。
方法:实验于2006-01/05在河南省红十字血液中心HLA实验室,美国海军骨髓库HLA实验室完成。造血干细胞血样由中华骨髓库提供。采用荧光微珠HLA分型方法对中华骨髓库捐献者血样进行HLA分型检测,无法给出确切结果的摸棱两可结果标本用基因克隆(TOPO TA Cloning)、DNA测序的方法确认新的HLA基因序列。
结果:通过克隆分离杂合等位基因,再进行测序确认发现新的序列与B^*3709相比,出现4个核苷酸改变:1.355nt C〉A,2.363nt C〉G,3.412nt G〉A,4.477ntC〉G,而且均发生在H哺B基因外显子3(exon3)。4处改变引起氨基酸编码改变:①编码95CTC〉ATC,氨基酸改变L〉1(亮氨酸〉异亮氨酸)。②97AGC〉AGG.S〉R(丝氨酸〉精氨酸)。③114GAC〉AACD〉N(天门冬氨酸〉天冬酰胺)。(9135GCC〉GCGA=A无氨基酸改变。
结论:①新的基因序列已经在GenBnak注册,被WHO的HLA因子命名委员会得到正式命名为HLA-B^*3712基因。②基因克隆是确认HLA新基因的根本方法。 相似文献
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由于中华骨髓库的建设推动了我国HLA分型检测技术的快速发展,从微量淋巴毒试验到SSP方法、到SSO杂交技术、再到基因芯片、DNA测序只经过了短短几年的时间[1-2].目前临床移植配型主要采用SSP方法,骨髓库建设则主要采用PCR-SSO荧光微珠流式杂交分型技术,该方法与SSP法相比,具有高通量、高分辨率、高可靠性等特点.但是由于现有的分型试剂均是以目前已经发现的基因序列为基础进行设计的,而且大多数是以西方人群资料为依据,在用来进行中国人群的HLA分型检测时不可避免的出现新的反应格局,有时无法与试剂盒所提供的判断模板相匹配,因而出现不确定的模棱两可结果. 相似文献
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克隆测序确认HLA新等位基因B^*3712 总被引:1,自引:0,他引:1
目的:由于技术原理的限制,目前尚不能对所有的HLA等位基因进行严格的区分,特别是以往没有发现的新基因序列只能通过测序的方法解决,然而,当遇到等位基因杂合时,测序给出的结果仍然无法确认新的序列改变发生在等位基因的哪一侧,这时需要用分子生物学方法分离杂合子然后进行测序才能确定新的基因序列。采用基因克隆方法确认HLA新等位基因。
方法:实验于2006-01/05在河南省红十字血液中心HLA实验室,美国海军骨髓库HLA实验室完成。造血干细胞血样由中华骨髓库提供。采用荧光微珠HLA分型方法对中华骨髓库捐献者血样进行HLA分型检测,无法给出确切结果的摸棱两可结果标本用基因克隆(TOPO TA Cloning)、DNA测序的方法确认新的HLA基因序列。
结果:通过克隆分离杂合等位基因,再进行测序确认发现新的序列与B^*3709相比,出现4个核苷酸改变:1.355nt C〉A,2.363nt C〉G,3.412nt G〉A,4.477ntC〉G,而且均发生在H哺B基因外显子3(exon3)。4处改变引起氨基酸编码改变:①编码95CTC〉ATC,氨基酸改变L〉1(亮氨酸〉异亮氨酸)。②97AGC〉AGG.S〉R(丝氨酸〉精氨酸)。③114GAC〉AACD〉N(天门冬氨酸〉天冬酰胺)。(9135GCC〉GCGA=A无氨基酸改变。
结论:①新的基因序列已经在GenBnak注册,被WHO的HLA因子命名委员会得到正式命名为HLA-B^*3712基因。②基因克隆是确认HLA新基因的根本方法。 相似文献
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