通过计算机寻找基因

发现新基因及其相关功能不仅可依靠特定目的基因（编码区）查找软件，而且还可以通过检索主要数据库，通过一定的程序发现与基因表达相关的特殊位点，如启动子和剪切位点等。现在还没有一个软件包能包含所有这些必要的工具。本文将描述几种主要的工具，介绍它们的工作原理、优点和局限，以及如何综合利用多个工具所得的结果，最优地辅助基因识别。     

妊娠滋养细胞恶性转化的研究进展

2003年世界卫生组织将妊娠滋养细胞疾病分为滋养细胞肿瘤（包括绒毛膜癌、胎盘部位滋养细胞瘤和上皮样滋养细胞瘤）．葡萄胎（包括完全性、部分性、侵袭性和转移性葡萄胎）和非肿瘤非胎块性滋养细胞病变（包括胎盘部位结节和胎盘部位过度反应）。临床常见的两个问题是：①葡萄胎与流产（尤其是伴有绒毛水肿者）的鉴别；②大约20％的葡萄胎会发展成侵袭性葡萄胎或绒毛膜癌，但是目前尚无可靠的形态学和分子生物学指标判定哪些病例会发生持续性滋养细胞病变或肿瘤，只能通过监测血hCG水平来决定是否需要化疗和判定化疗效果。     

与肺癌和胃癌转移可能相关的RAB5A基因

目的 研究和分离肿瘤转移相关基因,探讨肺癌及胃癌转移发生的分子基础。方法 应用细胞培养、ｍＲＮＡ差异显示技术、ｃＤＮＡ克隆、测序技术、ＲＴ－ＰＣＲ、Ｎｏｒｔｈｅｒｎ印迹杂交技术以及免疫组化技术,分析比较了细胞来源相同,但转移能力不同的人肺腺癌细胞系Ａｎｉｐ９７３和ＡＧＺＹ８３－ａ基因差异表达及其差异表达基因ＲＡＢ５Ａ在临床胃癌和肺癌标本中存在的实际意义。结果 在两细胞系之间确有明显的差异表达基因存     

Over-Expression of the RAB5 Gene in Human Lung Adenocarcinoma Cells with High Metastatic Potential

The objective of this study is to better understand the molecular mechanism of tumor invasion and metastasis, and isolating tumor metastasis-related genes. Two human lung adenocarcinoma cell lines AGZY-83a and Anip973 were studied, Anip973 was derived from AGZY 83a ,but it manifested a very much higher metastatic potential than the parent lirie. Differential cDNA fragments were isolated by oslag the techniques of mRNA differential display, and analyzed by means of molecular cloning and sequencing. The expression of RABSA gene in clinical samples of non-small cell lung cancer was determined by RT-PCR. There were significant differences between AGZY-83a and Anip973 in gene expression, part of the differential cDNA fragments were cloned and sequenced. We found that there was over-expression of RABSA gene in the Anip973 cell line. And there was over-expression of RABSA gene in those samples of ehnlcal lung cancer showing metastasis. In conclusion, the expression or over expression of RABSA gene was associated with the metastatic phenotype of Anip973. Probably, over-expression of RABSA gene in ncaa-trmall lung cancer may serve as a diagnostic marker for metastasis.     

人肺癌中OPB7-1 cDNA片段的克隆定位

目的：寻找肺腺癌发生及转移的相关基因，探讨肺癌发生发展的分子机理。方法：应用细胞培养、逆转录－PCR、RH基因定位及RNA原位杂交方法研究确定肺癌相关基因。结果：OPB7－1 cDNA片段，经RH基因定位方法定位于1p31-1p34。在正常人肺cDNA文库、低转移能力肺腺癌细胞系AGZY83－a cDNA中存在的片段大小一致，但序列中存在个别碱基的差别。OPB7－1 cDNA片段（974bp）与GenBank中已知序列同源性差，但与其有同源性的3个毗连群克隆均位于1号染色体上（1p31-1p34）。24例临床病例分析发现，该片段在肺癌组织中均有不同程度的表达，在正常对照组织中未见明显表达，且在有淋巴结转移病例的肺癌组织中表达程度呈明显增高的趋势。结论：提示OPB7－1可能为新的基因，与肺癌的发生、转移可能有一定的相关性。     

通过计算机寻找基因

发现新基因及其相关功能不仅可靠特定目的基因（编码区）查找软件，而且还可以通过检索主要数据库，通过一定的程序发现与基因表达相关的特殊位点，如启动和剪切位点等，现在还没有一个软件包能包含所有这些必要的工具。本将描述几种主要的工具，介绍它们的工作原理、优点和局限，以及如何综合利用多个工具所得的结果，最优地辅助基因识别。     

转化生长因子β1与成纤维细胞的相互作用影响食管癌细胞环氧合酶2表达

目的：探讨转化生长因子β1(TGF-β1)可否通过与成纤维细胞的相互作用调节食管癌细胞环氧合酶2(COX-2)表达。 方法： 以FS液、FSTB液(分别为10%FCS和加入5 μg/L TGF-β1培养24 h后的成纤维细胞培养上清)及含5 μg/L TGF-β1的完全培养基分别为食管癌细胞ECa-109、EC-18培养体系完全换液，24 h后逆转录-PCR及Western blotting分别检测各组COX-2 mRNA和COX-2、TGF-β受体Ⅰ、Ⅱ(RI、Ⅱ)蛋白表达。 结果： EC-18表达TGF-β RI、Ⅱ，ECa-109有RI而无RII表达。TGF-β1组、FS组及FSTB组COX-2蛋白与mRNA表达在EC-18细胞中分别为原来的0.103、2.368、2.793倍和0.368、1.895和4倍(均P<0.05)；在ECa-109细胞中为0.978、1.011(均P>0.05)、2.292倍(P<0.05)和0.980(P>0.05)、1.959、2.531倍(均P<0.05)。 结论： TGF-β1可能通过刺激成纤维细胞转而上调COX-2表达。     

长末端重复序列在人转移和非转移性肺癌中的表达

目的 :观察人类内源性逆转录病毒长末端重复序列 (humanretroviruslongterminalrepeat,HRTVLTR)在转移和非转移性肺癌中的表达 ,探讨HRTVLTR激活与肺癌转移的关系。方法 :采用PCR扩增 17例肺癌病人原发灶、邻近淋巴结及癌旁正常组织基因组中的内源性HRTVLTR ,证明内源性HRTVLTR的存在 ;以RNA斑点杂交检测 17例肺癌病人原发灶、邻近淋巴结及癌旁正常组织内源性HRTVLTR的表达 ,比较其在转移和非转移性肺癌中的表达差异。结果 :PCR结果显示 ,在转移能力不同的人肺腺癌细胞系 (AGZY 83a和Anip 973)及肺癌病人原发灶、邻近淋巴结及癌旁正常组织均获得了HRTVLTR扩增产物。 17例肺癌标本RNA斑点杂交分析发现 ,8例转移性非小细胞肺癌病人中有 5例原发灶及其转移淋巴结表现为HRTVLTR的高表达 ,4例小细胞肺癌无HRTVLTR的表达。结论 :人类基因中普遍存在内源性HRTVLTR ;HRTVLTR的高表达可能与非小细胞肺癌的转移有关     

BRI基因在人非小细胞肺癌细胞系中的差异表达

目的 研究BRI基因在人非小细胞肺癌细胞系中的表达，探讨其表达情况与肺癌转移能力的相关性。方法 应用半定量RT-PCR、Northern blot法分析一对来源相同、转移能力不同的人肺腺癌细胞系AGZY83-a和Anip973中BRI基因的差异表达，并检测另外6个肺癌细胞系SPC-A-1、A549、95D、TKB-18、GLC-82和PAa中BRI基因的表达情况，分析其过度表达与肺癌转移能力的关系。结果 BRI基因在两同源细胞系中确实存在明显的差异表达，在具有高转移潜能的Anip973中呈高表达。在其他6个不同转移潜能的肺癌细胞系中BRI的表达情况也与其转移能力有一定的相关性。BRI基因存在1．6kb和2．0kb两个转录本，在肺癌细胞系中以1．6kb转录本为主。结论 BRI mRNA尤其是1．6kb转录本的表达上调与非小细胞肺癌转移表型的形成可能有一定关系。