计算有机化合物脂水分配系数的新方法

A new method is presented for the calculation of octanol/water partition coefficients. On the basis of summation of atomic contributions, our algorithm, namely; XLOGP, also incorporate correction factors into the calculation. Multivariate regression analysis was performed on a training database of 1831 organic compounds with diverse structures to give the final model. The correlation coefficients for the whole set fitting is 0.968 and the standard deviation is 0.37. The result shows that our model is accurate enough for logP estimation in QSAR studies. Compared to other similar approaches, our method gives better results and is more convenient to use.     

一种橙光磷光铱(Ⅲ)配合物的合成、晶体结构及光电性质研究

采用二氯甲烷为溶剂,无水碳酸钾为缚酸剂,在25℃温和条件下,以2-苯基-4-甲基喹啉铱(III)氯桥二聚体[(4m2pq)2Ir(μ-Cl)2Ir(4m2pq)2]和乙酰丙酮(Hacac)进行配位,反应合成了新型铱(Ⅲ)配合物[(4m2pq)2Ir(acac)]。通过核磁共振氢谱(1H NMR)、碳谱(13C NMR)、X射线单晶衍射等确定分子结构,利用紫外-可见吸收光谱、发射光谱对其光物理性质进行研究。结果表明:(4m2pq)2Ir(acac)的单晶结构属三斜晶系,空间群为P1;(4m2pq)2Ir(acac)在二氯甲烷溶液中呈橙光发射,发射峰为597 nm,磷光寿命0.33μs,量子效率达50.4%。以(4m2pq)2Ir(acac)为客体掺杂在CBP中,制备了结构为ITO/NPB(30 nm)/CBP:(4m2pq)2Ir(acac)(质量分数6%和8%,20 nm)/BCP(10 nm)/Alq3(20 nm)/LiF(1 nm)/Al(150 nm)的橙色磷光有机电致发光器件,器件的最大亮度达到39 667 cd/m2,发射峰位于597 nm,最大电流效率为14.2 cd/A,最大功率效率为8.1 lm/W。     

用氨基酸加和法计算多肽的脂水分配系数

Based on amino acid addition model, a set of hydrophobicity contributions of amino acids was obtained from the multivariate linear regression analysis of peptides' octanol/water partition coefficients. Multivariate regression was performed on a training set of 219 peptides including dipeptides to pentapeptides which we compose 21 natural amino acids. The correlation coefficients for the whole set fitting are 0. 978 and 0- 974, for log P and log D respectively. In addition, a new test method -evolution test-for regression analysis was discussed. The result of evolution test for amino acid addition model shows the advantage of this new test method.     

凝血酶抑制剂的结构与活性的关系

应用了一种新的预测酶－配体复合物亲和性的方法来研究凝血酶抑制剂的结构－活性关系．凝血酶－抑制剂复合物的三维结构根据模板化合物的晶体结构进行搭建，然后使用程序SCORE计算复合物的亲和性．共分析了3个系列34个抑制剂分子．计算所得的复合物的解离常数与实验值吻合得很好，大大优于用分子力学所给出的结果．通过比较其中两个抑制剂分子的结构和活性，说明了此方法能够定量给出配体分子中每个原子对结合过程的贡献大小，给出十分直接的结构－活性关系．     

酶-配体复合物亲和性的计算

描述了一种新的计算酶－配体复合物亲和性的方法．它考虑了酶－配体结合过程中自由能变化的各主要因素，并利用经验公式加以计算、从蛋白质结构数据库中选取了66个酶－配体复合物作为训练集，利用回归分析得出最后的模型．此模型通用于各种类型的酶－配体复合物，计算结果比技准确，预测算合物解离常数的平均偏差小于一个数量级．此方法还可以定量评价配体分子中每个部分对结合过程的贡献大小，可以为先导他合物的优化提供非常直接的信息     

Protein Data Bank中抗体的自动识别

我们发展了一种名为KIAb（Keyword-based Identification of Antibodies）的方法用于自动识别Protein Data Bank（PDB）中的抗体结构。该方法通过读取PDB格式的文件，查找与抗体相关的特定关键词并做出判断。我们使用该方法从PDB中识别出780个结构文件，经人工检查其中767个为抗体，成功率高达98.3%。结果基本包括了抗体结构数据库Summary of Antibody Crystal Structures（SACS）中收录的所有条目，而且还包括该数据库没有收录的34个抗体结构。因此该方法对PDB数据库中抗体的识别更为完备而且具有很低的假阳性率。     

基于结构设计合成新型喹啉类分泌型PLA2抑制剂

磷脂酶A2(PLA2)在很多人类疾病的病理研究中起重要作用,是药物化学研究所的热点之一。因此,发展新型的PLA2抑制剂对生物有机研究和临床应用均有重要意义。我们设计合成分泌型PLA2的非底物类似物以寻找新型PLA2抑制剂。本文基于结构设计并合成了喹啉－4－乙酰胺作为PLA2抑制剂,目标化合物结构经1^HNMR,IR,MS和元素分析确认,初步活性检测显示该类化合物具有较好体外活性及动物活性。     

Theoretical study of thermoelectric properties of MoS2Theoretical study of thermoelectric properties of MoS2Theoretical study of thermoelectric properties of MoS2

We systematically studied the thermoelectric properties of MoS2 with doping based on the Boltzmann transport theory and first-principles calculations. We obtained an optimal doping region （around 1019 cm-3） for thermoelectric properties along in-plane and cross-plane directions. MoS2 in the optimal doping region has a vanishingly small anisotropy of ther- mopower possibly due to the decoupling of in-plane and cross-plane conduction channels, but big anisotropies of electrical conductivity cr and electronic thermal conductivity ke arising from the anisotropic electronic scattering time. The ~ is comparable to the lattice counterpart k1 in the plane, while tq dominates over tee across the plane, The figure of merit ZT can reach 0.1 at around 700 K with in-plane direction preferred by doping.     

端元提取技术在高光谱图像压缩中的应用

高光谱图像海量数据如何实现大比例有效压缩是限制其应用的主要问题之一,而现有有损压缩方法存在大压缩比与光谱特性信息准确保留的矛盾,即使现有最优有损压缩方法也不能够得到令人满意的结果。文章基于混合像元分解的思想提出基于端元提取技术的数据有损压缩方法来解决该矛盾,首先用顶点成分分析(VCA)方法提取场景中地物的端元光谱,根据各端元与观测像元之间的光谱间余弦角相似性度量方法估计各端元的丰度,接着对端元光谱及丰度数据进行无损压缩,最后利用JPEG2000有损压缩方法对高光谱图像的所有单波段图像进行空间维大比例有损压缩。AVIRIS高光谱图像的仿真结果表明,压缩比得到大幅度提高,光谱信息得到有效恢复。在实现压缩比为50∶1时,大部分像元的光谱角误差在2%左右。