Discovery of novel mRNA demethylase FTO inhibitors against esophageal cancer

A series of 1,2,3-triazole analogues as novel fat mass and obesity-associated protein (FTO) inhibitors were synthesised in this study. Among all 1,2,3-triazoles, compound C6 exhibited the most robust inhibition of FTO with an IC₅₀ value of 780 nM. It displayed the potent antiproliferative activity against KYSE-150, KYSE-270, TE-1, KYSE-510, and EC109 cell lines with IC₅₀ value of 2.17, 1.35, 0.95, 4.15, and 0.83 μM, respectively. In addition, C6 arrested the cell cycle at G2 phase against TE-1 and EC109 cells in a concentration-dependent manner. Analysis of cellular mechanisms demonstrated that C6 concentration-dependently regulated epithelial mesenchymal transition (EMT) pathway and PI3K/AKT pathway against TE-1 and EC109 cells. Molecular docking studies that C6 formed important hydrogen-bond interaction with Lys107, Asn110, Tyr108, and Leu109 of FTO. These findings suggested that C6 as a novel FTO inhibitor and orally antitumor agent deserves further investigation to treat esophageal cancer.     

不同血清型肉毒毒素受体结合域研究进展

肉毒毒素(botulinum neurotoxin, BoNT)是人类已知毒性最强的蛋白质之一,可以引起肌肉松弛麻痹,严重时可导致死亡。肉毒毒素共分为7种血清型(BoNT/A-BoNT/G),根据氨基酸序列差异可进一步分为40多种亚型。肉毒毒素分子结构由3个基本结构域组成：重链羧基端细胞受体结合域、氨基端的易位域和轻链催化域。在运动神经元表面,受体结合域首先与聚唾液酸神经节苷脂结合,随后与突触囊泡蛋白2或突触囊泡结合蛋白结合形成双受体复合物。每种血清型的受体结合域都必须与其相应受体结合才能发挥作用。肉毒毒素的结构功能及其对宿主的作用一直都是研究热点。近年来,因受体结合域可以促进肉毒毒素与运动神经元膜特异性结合,而成为新的研究方向。本综述将概述不同血清型肉毒毒素与受体结合过程中受体结合域结构变化和结合位点差异。通过分析不同血清型及亚型的序列以及受体结合域结构特征,可以更好地了解细胞受体结合域的序列差异和功能,并为肉毒毒素的治疗策略提供新思路。     

基于RS/GIS公路路域水土流失动态变化的研究——以榆靖高速公路为例

基于RS数据源,利用ERDAS和ArcGIS软件技术,对榆靖高速公路两侧300m范围水土流失动态变化开展研究。通过遥感图像数字处理方法,提取对水土流失起主导作用的植被覆盖度、土地利用类型、沟谷密度等因子;在矢量化等高线数据的基础上生成数字高程模型(DEM),提取地形坡度因子,将这4个因子在GIS中进行空间叠加分析。参照《土壤侵蚀分级标准》,生成研究区不同时段水土流失强度等级图,利用GIS属性统计功能对公路沿线各等级水土流失区面积进行统计,参照研究区不同侵蚀类型的土壤侵蚀模数,得出1996年和2006年公路沿线各流失区的水土流失量,并对公路沿线水土流失动态变化进行分析。结果表明：榆靖高速公路修建后沿线600m范围水土流失总量减少19.26万t/a,水土流失呈减弱趋势。公路施工期导致水土流失增强的各种因素随着营运期固化路面的形成而逐渐消失,防沙固沙和生态恢复等措施有效改善了公路路域生态环境,对公路沿线水土流失防治起到了积极作用。     

Genome‐wide distribution and functions of the AAE complex in epigenetic regulation in Arabidopsis

Heterochromatin is widespread in eukaryotic genomes and has diverse impacts depending on its genomic context. Previous studies have shown that a protein complex, the ASI1‐AIPP1‐EDM2 (AAE) complex, participates in polyadenylation regulation of several intronic heterochromatin‐containing genes. However, the genome‐wide functions of AAE are still unknown. Here, we show that the ASI1 and EDM2 mostly target the common genomic regions on a genome‐wide level and preferentially interacts with genetic heterochromatin. Polyadenylation (poly(A) sequencing reveals that AAE complex has a substantial influence on poly(A) site usage of heterochromatin‐containing genes, including not only intronic heterochromatin‐containing genes but also the genes showing overlap with heterochromatin. Intriguingly, AAE is also involved in the alternative splicing regulation of a number of heterochromatin‐overlapping genes, such as the disease resistance gene RPP4. We provided evidence that genic heterochromatin is indispensable for the recruitment of AAE in polyadenylation and splicing regulation. In addition to conferring RNA processing regulation at genic heterochromatin‐containing genes, AAE also targets some transposable elements (TEs) outside of genes (including TEs sandwiched by genes and island TEs) for epigenetic silencing. Our results reveal new functions of AAE in RNA processing and epigenetic silencing, and thus represent important advances in epigenetic regulation.     

Rapid improvement of rice eating and cooking quality through gene editing toward glutelin as target

Rice eating and cooking quality(ECQ) is a major concern of breeders and consumers, determining market competitiveness worldwide. Rice grain protein content(GPC) is negatively related to ECQ,making it possible to improve ECQ by manipulating GPC. However, GPC is genetically complex and sensitive to environmental conditions; therefore, little progress has been made in traditional breeding for ECQ. Here, we report that CRISPR/Cas9-mediated knockout of genes encoding the grain storage protein gluteli...     

充气和搅动对球形棕囊藻生长及囊体形成的影响

球形棕囊藻生活史中包含游离单细胞和球形囊体两种生活形态,但是实验室中培养的球形棕囊藻经常无法形成囊体。研究通过向培养基中泵入过滤空气,以及给培养基提供不同程度的搅动,研究了充气和搅动对球形棕囊藻生长及囊体形成的影响。充气和搅动均显著提高了囊体的数量,并且提高了囊体内细胞的生长速率。但是充气对于囊体直径及囊体内细胞密度并无显著影响。搅动则明显的提高了囊体直径和囊体内细胞数量。然而,尽管充气以及搅动有利于球形棕囊藻囊体的形成,但是培养的囊体直径依然小于自然海区中囊体的大小。     

基于GIS的广州市中心城区城市森林可达性分析

城市森林是城市中主要的生态功能景观,已经成为城市生态环境建设的主体。基于居民方便获取城市森林服务的要求,根据大型城市森林斑块、道路网和街区单元数据,利用ArcGIS9.2的Network Analyst工具,分析了广州市中心城区在2km步行距离内街区单元到达城市森林斑块的可达性以及城市森林斑块的承载力,并结合航片解译的树冠覆盖数据对具有不同可达性的街区单元进行了分析。分析结果表明：广州中心城区的外环高速以内的区域范围,分别有73%、46%和18%的的街区单元在步行2km、1km和0.5km距离内能够到达大型城市森林绿地斑块。从街区单元的行政归属看,以越秀区的街区可达性最好,而海珠区和原芳村区的街区可达性较差。研究范围内,0.5km内不能到达大型城市森林斑块且树冠覆盖超过30%的街区类型中,以公共管理单位类型为主,单位绿化对于树冠覆盖的贡献率大;而绝大多数以住宅类型为主的街区单元的树冠覆盖率低于10%,其中64%的街区树冠覆盖率低于5%。以街区单元为基本对象进行可达性度量,分析城市森林斑块现状分布和服务状况,并结合其树冠覆盖特征,可以明确需要重点关注区域的空间分布,可为广州市在较小尺度上的城市森林空间布局优化提供参考。     

我国甜菜夜蛾间歇性暴发的非均衡性循环波动

[摘要] 为进一步了解我国甜菜夜蛾Spodoptera exigua ( Hbner)间歇性暴发成灾的规律,作者应用时间序列分析技术研究了我国甜菜夜蛾间歇性暴发的时间序列波动规律。结果表明,在1949—2008年的60a中,我国甜菜夜蛾大尺度暴发总年频次为120次,各年度暴发次数(年频次)存在着非均衡性循环波动特征,并且在其波动过程中呈明显的上升趋势。按“年频次”强度,可将我国1949—2008年60a中甜菜夜蛾发生过程,划分成两个明显不同的阶段。第一阶段（1949—1984年）为平稳低发阶段,36a总年频次量为4次,年平均仅0.11次;第二阶段（1985—2008年）则为波浪式上升性高发阶段,24a总年频次为116次,年平均4.83次（为第一阶段的43.91倍））。按第二阶段24a（1985—2008）数据进行自相关系数和频谱图分析,结果表明,我国甜菜夜蛾大尺度暴发存在2.8a和11.2a2种不同长度的循环周期,其暴发趋势指数对滞后1a和滞后4a的影响为正相关,而对滞后5a和滞后6a的影响则为负相关。本文根据甜菜夜蛾暴发指数的非均衡周期性特征,建立了以时间序列为自变量的甜菜夜蛾暴发指数非均衡周期性预测模型,经回代结果检验,理论值与实测值之间无显著差异。     

哺乳动物毛被传热性能及其影响因素

毛被能够加强或减弱动物向周围环境的热量散失,毛被的形态结构和颜色是传热性能的决定因素,其传热过程往往是传导、对流和辐射3个过程的耦合。以往研究发现环境因子中,风可增加机体向环境中的散热速率,且散失量与风速正相关,且动物通过调节在风场中的姿态来适应不同风向。动物体与环境间的温差是影响散热速率的另一因素,不同环境中的动物通过改变毛被结构来适应温差变化。毛被含水率上升会引起导热和蒸发冷却作用加强,动物通过行为或毛被结构变化来调节毛被含水率。毛色决定毛被吸收和反射热辐射的能力。毛被传热性能直接把动物的生理特点与环境因子关联起来,这对揭示动物的适应、进化都具有重要意义。同时提出,毛被结构和传热性能的研究还有助于仿生学意义的挖掘。因此,今后应重点在毛被结构和物理性能、研究技术与方法以及毛被生物学和仿生学意义等方面开展研究。