北京市夏秋季腹泻病例病原菌调查

目的:了解北京市夏秋季细菌性腹泻病主要病原构成情况,进一步提高腹泻病的防控能力。方法:2010年4月-2010年10月从北京市6个区县13家二级以上医院的肠道门诊采集符合腹泻病定义患者的粪便标本进行病原菌检测,并对检测结果进行统计学描述和分析。结果:检测标本2024份,阳性率为22.0%(445/2024)。分离菌株以志贺菌为主,占所有菌株的42.2%(188/445),其次是副溶血弧菌,占30.6%(136/445),副溶血弧菌在远郊区县的阳性率较高,副溶血弧菌和志贺菌发病率高峰分别出现在8月和9月,儿童和青壮年是主要感染人群。结论:志贺菌和副溶血弧菌是北京市2010年细菌性腹泻病的主要病原菌,加强夏秋季海产品和生食等出售场所的卫生监督管理和重点人群的饮食安全教育是腹泻病防控的重要措施。     

一例H7N9禽流感感染病例病毒载量、耐药性与抗体水平变化分析

目的通过对北京市1例人感染H7N9禽流感病例连续检测H7N9病毒及血清抗体,掌握H7N9病毒载量、抗体、耐药性在病程发展中的变化。方法以24 h为间隔,共收集病例的下呼吸道盥洗液样本25份,血清样本23份。采用实时荧光定量反转录聚合酶链反应(real-time RT-PCR)法监测病程发展中下呼吸道盥洗液样本中的H7N9病毒载量变化、神经氨酸酶(NA)基因上R294K耐药位点变化;采用血凝抑制实验监测病例病程发展中血清样本中H7N9抗体水平变化。结果随着病程进展和临床抗病毒治疗的进行,病例H7N9禽流感病毒载量逐渐降低,抗体水平逐渐升高。病程后期部分样本中发现少量NA基因R294K耐药突变。结论 real-time RT-PCR和血凝抑制试验可用于人感染H7N9禽流感患者的病毒载量、耐药性变化和抗体水平变化监测,为临床救治提供依据。     

2010-2011年北京市四次甲型H1N1流感病毒抗体水平动态变化分析

目的 了解和掌握北京市不同人群对甲型H1N1流感的免疫水平.方法 在2010年1月-2011年4月期间,四次采用多阶段分层随机抽样方法,在北京市六个区分年龄组随机选取调查对象进行问卷调查,并采集血清标本进行甲型H1N1流感病毒抗体检测.结果 共选取调查对象18264名.5456名(28.9％)调查对象体内甲型H1N1流...     

新型冠状病毒巢式PCR检测方法的建立与初步应用

目的:建立一种检测新型冠状病毒的巢式PCR方法,作为实时荧光PCR法检测新型冠状病毒的补充,并探讨该方法在临床样本检测中的初步应用价值。方法:根据新型冠状病毒基因保守序列,利用在线软件设计N、S基因引物,构建巢式PCR反应体系,N基因巢式PCR及产物测序用于定性检测,S基因PCR产物测序用于型别初步鉴定。检测梯度稀释新...     

不明原因肺炎监测中SARS-CoV实时荧光RT-PCR检测方法的建立

Objective To develop and evaluate a real-time RT-PCR method for detecting SARS-CoV, based on TaqMan hybridization probe technology in order to provide a laboratory diagnosis for the examination of SARS-CoV infection during the surveillance of unexplained pneumonia. Methods Two pairs of primers and probes were designed to identify 1b and NP gene of SARS-CoV respectively. The two probes were 5'end labeled with FAM and 3'end labeled with TAMRA. The PCR reaction conditions were optimized according to the reaction conditions for detecting H5N1 which was set up by the National Influenza Center. Different concentration of plasmid DNA containing the target gene, 12 kinds of other respiratory viruses, mycoplasma pneumoniae and legionella pneumophilia were tested using this method to evaluate the specificity, sensitivity and reproducibility of the assay. Results All kinds of the viruses, mycoplasma pneumoniae and legionella pneumophilia tested were negative. The sensitivity of this assay for 1b gene was 10-9μg/ml DNA/reaction and for NP gene was 10 -7μg/ml DNA/reaction. The coefficients of variation (CV) value were 0.2% -0.9% during the reproducibility test. The whole process takes 2.5h including the extraction of RNA from the sample, and could be completed in the same machine, under the same condition with the detection of H5N1.Conclusion This real-time RT-PCR setting up based on TaqMan probe is a specific, rapid and sensitive method for detecting SARS-CoV. The establishment of this method will provide a strong support for quick examination of SARS-CoV infection during the unexplained pneumonia surveillance.     

2010-2011年北京市儿童甲型H3N2流感病毒的血凝素基因特征和遗传进化分析

目的了解2010年9月1日～2011年8月31日北京市儿童甲型H3N2流感活动特点,并对病毒血凝素的基因和进化特征进行研究。方法采集哨点医院收集的1 040份儿童流感样病例样本和14份疫情样本,进行MDCK细胞分离病毒。选取26株甲型H3N2流感毒株进行血凝素(HA1)基因的扩增和序列测定。采用生物信息软件进行序列比对和进化分析。结果 2010-2011年流感监测季期间,总共分离64株甲型H3N2毒株,占分离毒株构成的65.31%。病毒HA1基因出现了Ⅰ、Ⅱ两个明显分支,均有S214I氨基酸变异。另外,分支I的毒株序列还均出现P162S、R261Q氨基酸变异;分支II的毒株序列均出现D53N、K62E、Y94H、K144N、T212A、I230V氨基酸变异,涉及A、C两个抗原决定簇,并新增1～2个糖基化位点。结论 2010年9月～2011年2月期间北京市儿童甲型H3N2流感活动活跃,并且其毒株呈现出两个明显不同的进化分支,其中一个分支毒株的血凝素基因特性发生了明显改变。     

新型冠状病毒肺炎样本意外溢洒事故处理规范团体标准解读

生物安全管理是新型冠状病毒实验室检测的重要保障。样本溢洒意外事故处理是实验室应急预案中必须涉及的内容。北京预防医学会组织北京市CDC生物安全及新型冠状病毒实验室专家撰写的《新型冠状病毒肺炎样本意外溢洒事故处理规范（T/BPMA 0005－2020）》团体标准,是以国内外各级生物安全标准规范为依据,结合本次新冠肺炎疫情防控中的实际工作经验,以“科学性、规范性、适用性、可行性”为原则,经过各项风险评估,制定出的专门针对新型冠状病毒（高致病性）样本在包装不规范造成的样本溢洒、检测操作时发生实验室内溢洒以及在同一建筑物内转移样本时出现溢洒事故的处理及生物安全控制相关的标准,用以指导和规范北京市各级新型冠状病毒检测机构可能发生的样本意外溢洒事故处理。     

WSARE计算方法在猩红热暴发预警中的应用

目的用WSARE软件对猩红热监测数据进行分析,探测可能出现的暴发疫情。方法采用WSARE软件,应用基于历史数据基线的WSARE算法,对北京市2011年的猩红热监测数据进行分析,产生预警信号。结合原始监测数据,对预警信号进行描述和分级,评估出现暴发的可能性。结果共发出预警信号11次,双特征变量联合异常增高情况6次,单特征变量异常增高情况5次。出现高级别预警,暴发疫情存在可能性较大的有5月上、中旬西城区的学校和幼托机构;出现中级别预警,暴发疫情可能存在的有:5月中、下旬丰台区的幼托机构,5月下旬至6月初海淀区的幼托机构,6月中旬海淀区的幼托机构;出现低级别预警,暴发疫情存在可能性较小的有:6月上旬昌平区幼托机构,5月下旬朝阳区的学校。结论 WSARE计算方法是一种针对性强、灵活性强的时空预警方法。其可以实现对猩红热监测数据中的异常信号进行探测,早期提示可能出现的暴发疫情。     

2016－2017年北京市A组链球菌耐药特征及相关因素分析

目的 分析北京市2016 — 2017年A组链球菌耐药特征及相关影响因素。 方法 收集北京市2016 — 2017年16个 区分离到的A组链球菌,定量测定青霉素和红霉素等12种抗生素对菌株的最低抑菌浓度（MIC）。 结果 共对243株A组链球菌进行耐药性检测,菌株对头孢噻肟、青霉素、美洛培南和利奈唑胺的敏感率均为100%;对头孢吡肟、万古霉素的敏感率均为99.18%;对左氧氟沙星和氧氟沙星的敏感率分别为97.53%和90.95%;对红霉素、克林霉素和四环素敏感率分别为1.65%、2.06%和2.88%。 结论 北京市A组链球菌对大环内酯类抗生素,克林霉素和四环素等仍维持较高的耐药率,对青霉素类、头孢菌素类和喹诺酮类抗生素保持敏感,青霉素仍为治疗该菌感染的首选药物。      

2011-2014年北京地区儿童咽扁桃体炎感染病例A组链球菌emm分型研究

目的 了解2011-2014年北京市儿童咽扁桃体炎感染病例A组链球菌(group A streptococcus,GAS)emm基因型别分布情况。 方法 采集2011-2014年北京地区36家医院儿科门、急诊咽扁桃体炎感染病例咽拭子标本,分离GAS菌株,用聚合酶链反应(PCR)方法扩增emm基因进行测序和分型,分析不同人群,和临床诊断结果的emm型别特征。 结果 共有739个病例纳入研究,检测到10种emm基因型和32种emm基因亚型。主要基因型为emm12和emm1,分别占所有型别比例的62.2%和35.0%;主要基因亚型为emm12.00和emm1.00,分别占所有亚型的比例为53.2%和31.9%;发现两种新的emm亚型,分别为st1258和st485。基因型emm12 GAS感染人群主要分布在中心城区,占59.8%;基因型emm1 GAS感染人群主要分布在北部郊区,占49.4%。这两种基因型的地区分布,时间分布和感染人群的平均年龄差异均有明显的统计学意义,人群性别构成差异无统计学意义。 结论 北京地区儿童GAS咽扁桃体炎感染病例emm基因优势型别为emm12和emm1,这两种型别在不同地区和年龄人群中的分布存在明显差异。