猴痘病毒实时荧光PCR检测方法的建立

[目的]建立快速、特异的猴痘病毒实时荧光PCR检测方法.[方法]制备猴痘病毒阳性核酸样本,设计并合成相应的扩增引物及荧光标记探针,摸索最佳反应条件.[结果]本方法对模拟猴痘病毒样本的检测灵敏度达到102拷贝/反应,具有快速、灵敏、较高的特异性和重复性,可在3h内准确检测出猴痘病毒核酸的能力.[结论]本方法适合国境口岸猴痘病毒快速检测,对防止猴痘病毒传入我国,保障国境卫生安全具有重要意义.     

非洲籍输入性基孔肯雅热一例的实验室诊断

基孔肯雅热是由基孔肯雅病毒引起,经伊蚊叮咬传播,以发热、关节疼痛、皮疹和轻度出血为主要特征的病毒性急性传染病.基孔肯雅病毒是单股RNA病毒,属于披膜病毒科甲病毒属.1952年研究人员发现基孔肯雅热在坦桑尼亚流行,并从严重关节炎患者血液中分离出基孔肯雅病毒.1956年,Ross[1]从急性期患者的血液及野外捕获的埃及伊蚊体内分离出基孔肯雅病毒.近年来,本病在东非海岸、印度洋岛屿、印度及东南亚地区流行,导致超过200 万人感染发病,且流行地区不断扩大,发病人数不断上升[2].     

输入性甲型H1N1流感病毒M、NP、PB1基因进化特征

目的 分析口岸输入性甲型H1N1流感病毒的M、NP和PB1基因进化特征,及时发现变异株.方法 对广东口岸2009-2011年检测的甲型H1N1流感阳性病例进行M、NP和PB1基因的RT-PCR扩增和核苷酸序列测定.以2009年甲型H1N1流感代表株A/California/04/2009/H1 N1的M、NP和PB1基因作为参考序列,分析输入性病例的系统进化树、核苷酸及氨基酸序列同源性和变异位点.结果 M基因系统进化树分为4个分支,2009年病毒与2010年病毒主要分布在第Ⅰ分支,2011年检出的多数病毒聚集于第Ⅳ分支.同源性结果显示M基因高度保守,仅有5个核苷酸位点发生显著变异,对应的蛋白序列仅在氨基酸V80I位点出现突变.所有病毒NP蛋白均出现V100I突变,同时零星出现K452R突变.PB1蛋白氨基酸序列在G154D、I397M和I435T等位点发生较明显突变.结论 2009-2011年输入性甲型H1N1流感病毒M、NP、PB1基因已发生一定程度的变异,对口岸和国内流感防控提供了重要的理论依据.     

黄热病毒与甲型流感病毒及其分型集合检测芯片的初步研制

目的：研制黄热病毒与流感病毒及其分型集合检测芯片。方法：设计并合成60mer寡核苷酸（Oligo）探针用于制备检测芯片。提取黄热病、甲型流感病毒核酸,以限制性显示技术进行扩增标记,完成杂交后对芯片进行扫描和数据分析。结果：Oligo探针与相应的荧光标记样本杂交后,大部分能检测出阳性荧光信号,而空白对照和阴性对照均为阴性信号。结论：寡核苷酸芯片技术可应用于多种病毒的检测及分型,从而为多种病毒感染的早期鉴别诊断提供科学依据。     

军团菌快速检测方法的建立及其在国境口岸的应用

目的:建立适合口岸出入境大厅及其他公共设施中央空调水的分子生物学检测方法,以实现中央空调水的快速检测,提高检测速度及灵敏度。方法:根据军团菌核酸序列多重比对结果设计并合成实时荧光PCR的引物和探针,分别对军团菌16SrDNA和Mip基因相应片段进行扩增;建立快速、特异的军团菌分子快速检测新方法,并将该方法应用于对口岸中央空调水进行快速检测。结果:本研究以16SrDNA目标序列检测结果判断样本中是否存在军团菌,以Mip目标序列检测样本中是否存在嗜肺军团菌;本研究的方法快速、特异,能在2 h内完成对空调水样的检测。结论:本方法大大提高了军团菌的检测速度,提高了检测灵敏度,非常适合应用于中央空调水的快速检测。     

江门市工厂企业与建筑工地集体食堂联合执法检查效果评价

[目的]评价联合执法检查对改善工厂企业与建筑工地集体食堂卫生状况的效果。[方法]对江门市市区121家集体食堂联合执法检查前(2003年4月)和联合执法检查1年后(2004年4月)的卫生状况进行比较。[结果]联合执法检查1年后,食堂基础卫生设施与食堂卫生许可证持证率变化不明显;从业人员健康证持证率与基本卫生知识知晓率明显提高;有管理机构、有卫生制度、有食品冷藏设施、废弃物加盖者所占比例明显增加,有毒有害物品存放者所占比例明显减少;但发生交叉污染与食物中毒者所占比例减少不明显。[结论]联合执法检查对进一步提高企业与建筑工地集体食堂食品安全卫生意识和自身管理水平起到积极的促进作用,提高了从业人员卫生知识水平,减少了食物中毒的发生。但不能解决基础卫生设施简陋、交叉污染和无证经营问题。     

逆转录聚合酶链反应检测疟原虫混合感染的研究

〔目的〕建立在同一反应体系中能同时检测和鉴定恶性疟、间日疟的一步逆转录聚合酶链反应（RT-PCR）检测方法,并用于国境口岸归国劳务人员的疟疾检测。〔方法〕以疟原虫小亚单位核糖体核糖核酸基因为靶片段,设计恶性疟原虫和间日疟原虫的上游通用引物和各自的下游特异性引物,在同一反应体系中同时扩增恶性疟原虫和间日疟原虫的特异片段,对疟疾患者的PCR产物进行序列测定和分析。〔结果〕用建立的RT-PCR检测方法对广东口岸回国劳务人员中发现的2名疟疾患者的不同采样时间的全血进行检测,2006年10月和2007年1月采集的样本被分别扩增出预期大小为360bp和450bp特异扩增带,推测2名患者为恶性疟原虫和间日疟原虫的混合感染,其在入境时处于恶性疟的发作期和间日疟的潜伏期,均属于典型的集体输入性疟疾案例。〔结论〕RT-PCR检测疟原虫方法具有敏感性高、特异性强的特点,对国境口岸疟疾诊断、镜检质量控制和流行病学研究具有较大的实用价值。     

实时荧光RT—PCR快速检测蚊体内乙型脑炎病毒及福建省基因Ⅰ型乙型脑炎病毒的发现

目的:应用实时荧光RT-PCR方法快速检测蚊体内乙型脑炎病毒,并对蚊体内携带的乙型脑炎病毒进行基因分型。方法:从蚊媒监测点采集蚊标本,研磨后提取RNA,用新型的LNA探针实时荧光RT-PCR方法进行高通量快速筛查蚊体携带的乙型脑炎病毒,对核酸阳性的标本进一步用乙型脑炎病毒E基因特异引物进行RT-PCR扩增和序列测定,根据所测序列与GenBank中不同地理来源乙型脑炎病毒株E基因核苷酸序列分析的结果进行基因型别的判定。结果:12575只蚊子分成254份,用实时荧光RT-PCR方法从来源于福州的2份三带喙库蚊标本中检出乙型脑炎病毒核酸阳性,经RT-PCR及核苷酸序列测定,得到一段长1500nt的E基因核苷酸序列,序列分析结果显示,其核苷酸同源性最大的是来源于上海(DQ404100)和浙江(EU258742)的毒株,分别是99.1%和99.0%,均属于基因Ⅰ型病毒。结论:实时荧光RT-PCR方法是快速检测蚊体内乙型脑炎病毒的理想方法,此次调查发现的乙型脑炎病毒是以往福建省内未见报道的基因Ⅰ型病毒。     

马尔堡病毒的实时荧光RT-PCR检测方法研究

目的建立马尔堡病毒的实时荧光RT-PCR检测方法。方法人工合成马尔堡病毒特异性核酸序列作为阳性对照模板,设计实时荧光RT-PCR引物、探针并构建反应体系,对反应条件进行优化,验证该方法的特异性、灵敏度。结果建立的马尔堡病毒实时荧光RT-PCR检测方法对马尔堡病毒核酸检测有高度特异性,与1型～4型登革病毒、日本脑炎病毒和基孔肯雅病毒均无交叉反应,检测灵敏度为102拷贝/反应。结论该方法灵敏度高、特异性强,适用于对马尔堡病毒的快速检验。