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目的 了解安徽省2018—2019年手足口病（HFMD）柯萨奇病毒A组16型（coxsackievirus A16,CV-A16）分子病原学进化特征。方法 对安徽地区2018—2019年从HFMD患者咽拭子样本中分离的CV-A16毒株,采用反转录聚合酶链式反应（RTPCR）扩增其VP1基因全长核酸片段、测定其核苷酸序列。采用肠道病毒在线分型工具鉴定CV-A16毒株基因亚型,运用MEGA 6.0生物软件最大似然法（maximum likelihood method）构建VP1基因进化树、MegAlign比较核苷酸和氨基酸同源性。结果 安徽省2018—2019年共分离到HFMD CV-A16毒株88株。其中2018年分离到30株,2019年58株。其VP1区全长基因均由891个核苷酸碱基组成,编码297个氨基酸。基因分型鉴定和进化分析显示,88株CV-A16毒株中B1a和B1b基因亚型分别为25株（28.41%）、63株（71.59%）。VP1区遗传进化表明,88株CV-A16毒株均归为B1基因型,其中25株属于B1a基因亚型,63株属于B1b基因亚型。同源性分析显示,B1a基因亚型毒株与... 相似文献
