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运用Gaussian98 MP2/6 311G(d, p)级的从头计算法计算了DNA分子中胞嘧啶碱基中H13质子的势能曲面。 发现有两个势阱: 其中一个对应正常的胞嘧啶, 而另一个则对应它的顺式亚胺式互变异构体。 质子在这两个势阱的束缚对热扰动是稳定的。 质子在势阱中像单摆一样绕着离它最近的氮原子摆动, 还可以远离氮原子与其它碱基形成氢键。 估算出的H13质子从一个势阱到另一个势阱的穿透几率表明质子呆在其中一个势阱中的寿命大约是6×102 a, 这使胞嘧啶和它的顺式亚胺式互变异构体在室温气相实验中远不能达到热平衡。 对这些结果的生物学意义作了讨论。 The potential energy surface of the H13 proton in base cytosine of theDNA molecules is calculated ab initio at the Gaussian98 MP2/6 311G(d, p) level. Two potential wells are found. One corre sponds to the normal cytosine, while the other corresponds to its imino tautomer. The bindings of the proton in these wells are stable enough against the thermo disturbance. The motions of the proton in these wells are oscillations around the nearest nitrogen atom like the pendulum, and may move far away from the nitrogen atom to form the hydrogen bond with other bases. The estimated tunneling probability of the H13 proton from one well to another well shows that the life time of the proton staying in one of these wells is about 6×102 a. It is too long to let tautomers of cytosine be in thermodynamical equilibrium in a room temperature gas phase experiment. The biological significance of these results is discussed. 相似文献
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First-Principles Studies on Electronic Structures and Absorption Spectra of PbWO4 Crystals with Defect [V^2- Pb-V^2+ o-V^2- Pb]^2-c 下载免费PDF全文
Electronic structures and absorption spectra for perfect PbW04 (PWO) crystals and the crystal containing aggregated defect [V^2- Pb-V^2+ o-V^2- Pb]^2-have been calculated using density functional theory code CASTEP with the lattice structure optimized. The calculated absorption spectra of the PWO crystal containing the aggregated defect [V^2- Pb-V^2+ o-V^2- Pb]^2-exhibit two absorption bands peaking at 1.90eV (65Onto) and 3.02eV (41Onto). It is predicted that the 420 and fiSOnm absorption bands are related to the existence of the aggregated defect [V^2- Pb-V^2+ o-V^2- Pb]^2-in the PWO crystal. 相似文献
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对赝标耦合和赝矢耦,严格求解了经典π场中对称核物质能量与π场Φ及其波数k的关系。结果表明,赝标耦合下无π凝聚,赝矢耦合下则可有。如允许赝矢耦合(它不能重整化),则π凝聚可当作πˉ广核子P波作用的结果而毋需手征对称性。πˉ核子作用本身会使凝聚的π场饱和而毋需引入π场的非线性自作用如Φ4项等。用Van der waals近似考虑了核子排斥心的影响,发现它导致凝聚π场波数的上下限。如排斥心半径超过一临界值,π凝聚即不能发生。 相似文献
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使用密度泛函缀加平面波法,按照能量最低原理采用共轭梯度方法对几种含铅空位和不含铅 空位的钨酸铅晶体进行结构优化处理,计算了铅空位周围晶格的弛豫,得到铅空位周围的晶 格结构,同时对计算结果进行了讨论;在得到几何优化结构的基础上,利用相对论性密度泛 函离散变分法进一步计算了几种钨酸铅晶体结构的电子态密度.计算结果表明:1)铅空位周 围的晶格驰豫的结果使铅空位的局部电负性减弱.2)Pb 6s态的能级位于离价带顶10eV左右 ,说明Pb 6s态上的电子很难再失去,所以在钨酸铅中不太可能存在Pb3+或Pb4+ .3)价带顶主要由O的2p态占居,氧的2p态最容易失去电子.4)铅空位周围的可能形成的 色心是VF- VK+缔合色心.
关键词:
铅空位
PbWO4晶体
结构优化
电子结构
色心 相似文献
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超紫外波段的X射线底片相对标定 总被引:1,自引:0,他引:1
介绍X射线底片在超紫外波段(19.0~22.0nm)的相对标定方法。在LF-11激光装置上,用激光产生等离子体作为标定源,同时控制显影条件和底片类型与测X光激光时相同,标定出美国Kodak公司生产的SWR型底片特性曲线。解决了底片响应对所测X光激光增益系数的影响。结果表明,在超紫外波段,波长对特性曲线影响可不考虑。 相似文献
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