玉米重要农艺性状的基因组预测分析

以玉米自交系郑683-1为轮回亲本,ZPH1388、ZPH5和东237为供体亲本构建BC3F5群体,对穗部和株型性状进行基因组预测分析,研究2种交叉验证方式、6种GS方法和显著数量性状位点(QTL)作为固定效应对预测准确性的影响。结果表明,相比5折交叉验证,10折交叉验证可以提高穗粒数、行粒数、株高和穗位高的预测准确性,降低穗行数和叶夹角的预测能力。相比随机效应模型,穗粒数、穗行数、行粒数和叶夹角将1～2个QTL作为固定效应可以提高基因组估计育种值的准确性,将1～5个QTL作为固定效应会降低穗位高的预测能力。对于株高,贝叶斯A和再生核希尔伯特空间将1～5个QTL作为固定效应可以提高预测的准确性,其他4种方法多数情况固定效应的加入会降低株高的预测能力。在穗粒数和株高中,基因组最佳线性无偏预测的准确性最高,略高于4种贝叶斯方法,再生核希尔伯特空间的准确性最低。对于其他4个性状,最优预测方法受不同交叉验证方式和固定效应模型的影响表现不一。     

玉米穗长一般配合力多位点全基因组关联分析和预测

穗长是一个重要的农艺性状,与产量密切相关。一般配合力(general combining ability, GCA)是评价优异自交系的重要指标。因此,解析穗长GCA的遗传基础,制定相应的育种策略对玉米杂交种产量的提高具有重要意义。本研究以123个玉米自交系和8个测验种按照North Carolina II遗传交配设计组配的537个F1杂交种为试验材料,在2个环境下进行表型鉴定,利用玉米5.5 K液相育种芯片鉴定的11,734个SNP (single nucleotide polymorphisms)对2个环境以及综合环境穗长GCA进行多位点全基因组关联分析(multi-locus genome-wide association study, MGWAS)和基因组预测。利用7种MGWAS共检测到11个穗长GCA显著关联SNP标记(P <8.52E-07),单个位点解释GCA变异介于8.06%～28.23%之间。不同MGWAS共定位的SNP位点有5个。位点7＿178103602在周口和综合环境利用mrMLM(multi-locusrandom-SNP-effectmixedlinea...     

不同植物提取物对玉米霉变的影响研究

玉米霉变会导致饲料适口性和营养价值下降，并对动物健康造成潜在威胁。目前使用的防霉剂与脱霉剂效果单一，并对饲料适口性存在一定的影响。植物提取物防霉防腐具有颇多研究成果，但由于使用成本高，在饲料生产中的使用受到限制。随着技术发展，植物提取物应用于饲料生产逐渐具有可行性。本研究在玉米中分别添加0.5%的大蒜提取物、甜叶菊提取物、甘草提取物、双乙酸钠，并设置空白组。玉米贮存60 d，在第30和60天观察玉米营养成分的变化，并在第15、30、45、60天检测玉米赤霉烯酮、黄霉毒素B1和呕吐毒素含量，结果表明，大蒜提取物、甜叶菊提取物、甘草提取物对贮存期间水分含量、粗蛋白质、粗脂肪含量的保持具有显著作用|霉菌毒素检测结果显示，3种植物提取物对玉米赤霉烯酮、黄霉毒素B1及呕吐毒素的产生有显著抑制作用，尽管在60 d贮存期内与双乙酸钠存在一定差异，但该类毒素含量并未超过国家标准。综合研究结果表明，0.5%大蒜提取物比甜叶菊提取物、甘草提取物效果更明显，建议在玉米防霉中应用。 [关键词]植物提取物|玉米|霉菌毒素     

玉米农艺性状配合力全基因组关联分析和预测

一般配合力（GCA）是评价亲本自交系利用价值的一个重要指标。为解析玉米配合力遗传机理，以NCII遗传交配设计获得的537份杂交组合为材料，结合玉米5.5K液相育种芯片的11 734个高质量单核苷酸多态性（SNP）标记，采用7种多位点全基因组关联分析（MGWAS）方法挖掘新乡、周口和综合环境穗行数、粒长和粒宽GCA显著关联位点，并在MGWAS研究基础上利用5种基因组选择方法对GCA效应开展预测研究。结果表明，共检测到46个SNPs与穗行数以及2个籽粒性状GCA显著关联（P<8.52×10-7），其中10个位点被2～5种MGWAS方法同时检测到，8个SNPs被至少2个环境共定位。6个SNPs(1＿43440622、2＿69742504、2＿71037706、2＿197716855、5＿219239213和8＿134634317)为环境稳定和MGWAS方法稳定重叠的位点，是控制穗行数和籽粒性状GCA效应的重要位点。穗行数和粒宽GCA利用5种随机效应模型取得较高的预测准确性，为0.62～0.74，粒长GCA基因组预测精度较低，为0.28～0.45。3个环境中，多数情况下将不同MGWAS挖...