4种病原菌特异基因片段阳性蜱的16S rRNA基因克隆文库分析

Objective To develop the method of 16S rRNA gene clone library for tick bacterial flora analysis, and to analyze the detection effective of pathogens in tick and capacity of bacterial flora diversity. Methods Primers were designed according to the specific gene of Borrelia burgdorferi, Bartonella henselae, Anaplasma phagocytophilum, Ehrlichia chaffeensis and templates were choosen by positive PCR result to amplify the DNA extracted from the ticks. One set of primers targeting 16S rRNA gene conserved region were chosen to amplify certain fragments, DNA extraction, PCR reaction, cloning and sequencing. Nucleotide sequences were compared with GenBank database. Calculated Coverage values of clone library and Shannon-Wiener diversity index. Results Sixteen defined genus-or species-bacteria were detected in 103 valid sequences. Eight species were edge type (Clone No. > 5). Three kinds of pathogens were identified (Borrelia burgdorferi, Bartonella henselae and Rickettsia sp). Three kinds of pathogens were not edge type(Clone No. < 5). Coverage value was 96.11%, and Shannon-Wiener index was 2.40. Analysis results of cloning sequence showed that tick-parasitic bacteria mainly were α and γ deformation mycetes which accounted for 56.25% (9/16). Conclusions The 16S rRNA gene sequences technology could make relative quantitative of bacterial flora, and detect many kinds of pathogens in tick. It's a good method for detection of pathogens and bacterial flora analysis.     

鼠疫菌102kb基因座一端IS100的缺失与pgm+稳定性的研究

目的 了解鼠疫菌102kb pgm基因座一端IS100的缺失与pgm~1稳定性的关系。方法 采用聚合酶链式反应(PCR)扩增国内各型鼠疫菌102kb pgm基因座色素沉着这一端IS100的片段,并选择克隆测序分析。结果 通过PCR扩增,其中只能扩增出约2560bp左右条带的生态型,也就是其102kb pgm基因座色素沉着这一端IS100的片段缺失,除锡林郭勒高原布氏田鼠型,还有北天山东段型、北天山西段A、B型,其pgm~ 表型非常稳定;而有一部分菌株的扩增结果为阴性另一部分菌株扩增出4492bp条带的生态型,扩增出4492bp条带的菌株102kb pgm基因座色素沉着这一端有IS100,结果为阴性的菌株其整个102kb pgm基因座可能已经丢失,此种情况包括祁连山型,青藏高原型,冈底斯山型,滇西纵谷型等,其pgm~ 表型表现出不稳定。结论 鼠疫菌102kb pgm基因座一侧缺失IS100的菌株,可具有较稳定的pgm~ 表型,而鼠疫菌102kb pgm基因座两侧有IS100的菌株,pgm~ 表型不稳定。     

肌少症性肥胖与老年高血压的相关性临床研究

目的 探讨老年人肌少症性肥胖与高血压的相关性,为临床防治老年高血压提供参考。方法 选择2018年1月—2021年1月在内蒙古自治区人民医院老年医学中心住院的老年患者210例,其中高血压134例(63.81%),非高血压76例(36.19%),分别测定2组患者身高、体重、四肢骨骼肌肉量(ASM)、握力、血糖、血脂、肝肾功能,计算体重指数(BMI)及四肢骨骼肌质量指数(RSMI),并进行比较分析。结果 高血压组ASM、RSMI低于非高血压组[(14.90±3.38)kg vs.(19.41±1.56)kg,P<0.001;(5.59±1.37)kg/m² vs.(7.11±0.84)kg/m²,P<0.001]。高血压组年龄和BMI高于非高血压组[(72.79±7.20)岁vs.(70.79±6.51)岁,P=0.046;25.66±3.48 vs. 24.46±2.81,P=0.011]。高血压组肌少症及肌少症性肥胖患病率均高于非高血压组(67.91%vs. 38.16%,P<0.001;25.37%vs. 2.63%,P&l...     

布氏田鼠鼠疫菌102 kb pgm基因座结构研究

目的　研究布氏田鼠鼠疫菌株 1 0 2kbpgm基因座结构与其他类型鼠疫菌是否有区别 ,及其与布氏田鼠鼠疫菌株的独特特征的关系。方法　采用聚合酶链反应 (PCR)的方法 ,共设计 2 5对嵌套的引物 ,以喜玛拉雅旱獭鼠疫菌株和布氏田鼠鼠疫菌株的染色体DNA为模板 ,分段扩增该区域内的DNA ,选择差异较大的扩增片段进行克隆和测序 ,与已发表的序列比较。结果　布氏田鼠鼠疫菌株的 1 0 2kbpgm基因座一端缺失了1 952个碱基 ,即插入序列IS1 0 0。另外 ,在测序的这段基因中 ,一类似于可变数量串联重复序列 (VNTR)的区域 ,布氏田鼠鼠疫菌比已发表的序列多出几个拷贝。结论　布氏田鼠鼠疫菌株的 1 0 2kbpgm基因座序列改变了 ,一端缺失了插入序列IS1 0 0 ,这就使得它的毒力岛不容易丢失 ,保持了 pgm+表现型的稳定 ;与其毒力的关系 ,有待于进一步研究     

鼠疫耶尔森菌的多重PCR检测方法

目的研究一种快速、特异的检测鼠疫耶尔森菌(鼠疫菌)的多重聚合酶链反应(PCR)方法。方法选用针对鼠疫菌F1抗原基因、pla基因、inv基因和一段鼠疫特异染色体序列设计的4对引物,以鼠疫菌及其他肠道致病菌DNA为模板并加入内部对照模板,在同一扩增体系中进行PCR扩增。结果鼠疫菌DNA模板可扩增出预期产物,而其他菌株只能扩增出内部对照模板的片段。结论多重PCR方法具有较高的特异性。可迅速、有效地将鼠疫菌与其他肠道致病菌相鉴别,也可应用于鼠疫监测。     

内蒙古蒙古族寻常性银屑病与HLA-Cw*0602,-DQB1等位基因的相关性

目的探讨内蒙古蒙古族寻常性银屑病与HLA-Cw*0602,-DQB1等位基因的关联性。方法利用序列特异性引物-聚合酶链反应(PCR-SSP)分型技术,对蒙古族寻常性银屑病患者65例及对照组正常蒙古族60例样本进行分型检测并比较分析。结果①寻常性银屑病患者组HLA-Cw*0602,-DQB1*0201等位基因频率较对照组明显升高,差异有统计学意义(P0.05);②HLA-Cw*0602,-DQB1*0201在Ⅰ型及家族史阳性银屑病患者中显著升高(P0.05);③HLA-DQB1*0301在患者组中有显著下降(P0.05)。结论①HLA-Cw*0602及-DQB1*0201可能是内蒙古地区蒙古族寻常性银屑病的易感基因;有家族史和无家族史银屑病患者可能存在遗传背景上的差异。     

基因预测方法的研究进展

基因预测一般指预测DNA序列中编码蛋白质的部分。其方法主要有两大类：一类是基于相似性的预测方法,即利用已知的mRNA或蛋白质序列为线索在DNA序列中搜寻所对应的片段,达到基因预测的目的;另一类是基于统计学模型的从头预测方法,即利用统计学模型训练出相应参数,再对基因进行预测,这种方法可不依赖已知的DNA序列进行预测。现就基因预测的方法、基因预测中存在的一些问题等做一概述。     

鼠疫耶尔森菌特异基因扩增引物应用于鼠疫菌的鉴定研究

目的研究一种快速鉴定鼠疫菌的PCR方法。方法选用针对鼠疫菌特异序列的6对引物进行PCR扩增,以其它近缘的肠道致病菌做对照,并测序比较鉴定。结果鼠疫菌均能扩出预期产物,而其他近缘的肠道致病菌菌株均不能扩出预期产物。结论这些引物具有较高的特异性,可迅速、有效地鉴定鼠疫菌,并与其它近缘的肠道致病菌相鉴别。     

鼠疫菌pMT质粒的模块结构及其连接方式

鼠疫的致病菌鼠疫耶尔森菌有3个常见的质粒，编码一系列的毒力因子；其中最大的质粒pMT编码F1抗原和鼠毒素，是鼠疫菌两个比较重要的毒力因子。     

炭疽芽孢杆菌传统鉴定指征与毒力基因关系的评价

目的 重新评估炭疽芽孢杆菌传统鉴定指征对确定具有致病能力的炭疽芽孢杆菌的意义。方法 采用常规的细菌学方法和PCR扩增毒力基因检测,并根据是否具有毒力基因,比较传统鉴别指征的表现差异。结果 菌落形态,溶血与动力阴性,是与毒力基因存在相关的最重要特征。结论 在判断炭疽芽孢杆菌对人与环境的危害时,首先应确定是否存在致病性决定基因。在无条件进行这种检测时,数种传统的鉴别方法具有一定的参考价值。