真核基因的转录调控

自从1953年Watson和Crick确立了DNA的双螺旋结构,近40年来分子生物学研究阐明了遗传信息的传递是由DNA→RNA→蛋白质的“中心法则”以及其逆向转录的补充。然而,直到70年代基因工程技术问世,才有可能深入研究基因表达的时空调控机制。真核基因中由组蛋白和DNA形成的“串珠状”核小体是染色质结构的基本单位。真核基因转录前染色质结构改变     

多囊卵巢综合征颗粒细胞氧化应激相关基因及基因-转录因子调控网络

目的 多囊卵巢综合征（PCOS）的发生发展与氧化应激密切相关。本研究旨在鉴定PCOS颗粒细胞的氧化应激相关基因及基因-转录因子网络。方法 R软件下载来自基因表达数据库（GEO）的GSE34526数据集,与氧化应激相关的基因通过Python软件在基因本体论（GO）数据库获得。对差异表达的氧化应激相关基因进行GO富集分析、京都基因与基因组百科全书（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG）信号通路富集分析和蛋白-蛋白相互作用（PPI）网络分析。最后,使用Network Analyst web工具查找关键差异基因的转录因子（TFs）。结果 7例PCOS患者和3例健康对照女性共检测到63个氧化应激相关差异基因。GO和KEGG富集分析显示,差异基因与肿瘤坏死因子（TNF）信号通路、叉头框蛋白O(FoxO)信号通路、凋亡和氧化应激等方面有关。PPI结果显示,各基因间存在显著的交互作用。基于35个关键基因（Hub gene）中的前22个,我们发现了14个转录因子。结论 我们鉴定出63个潜在的PCOS颗粒细胞氧化应激相关基因,包括35个关键基因和14个转...     

端粒酶逆转录酶基因的结构特点及转录调控

调节端粒酶活性的最主要成份是端粒酶逆转录酶 (h TERT) ,它往往在肿瘤发生的早期已表达 ,故对其研究具有重大的临床意义。近年 h TERT基因启动子区已克隆鉴定 ,研究发现在其核心启动子区含有多个转录因子结合位点 ,体内外的转录因子结合在这些位点和“Cp G岛”甲基化、组蛋白去乙酰化以及 h TERT转录变异体的自身调节等构成了对 h TERT基因转录调控的复杂系统。研究 h TERT基因的转录调控将对肿瘤的发生发展、诊断和治疗提供重要的帮助     

苯丙酸诺龙对烫伤模型大鼠雄激素受体介导靶基因转录调控的影响

背景：中重度烧创伤一直是临床全身治疗的难点,与创面局部处理并重,极大影响治疗预后。同化激素在烧伤动物模型与临床患者的使用治疗中取得安全良好效果。同化激素的应用虽受运动兴奋剂管理的限制,但其雄激素受体与核受体辅助调节因子仍是近年来基因调控机制研究的热门新兴领域。目的：探索苯丙酸诺龙对烫伤大鼠体内雄激素受体介导靶基因转录调控的影响。方法：将36只大鼠随机分为苯丙酸诺龙组、模型组与对照组。苯丙酸诺龙组和模型组大鼠以热水制成20%体表面积深Ⅱ度烫伤大鼠模型后2 d,分别后肢肌肉注射苯丙酸诺龙和生理盐水,隔日1次,连续21 d。结果与结论：苯丙酸诺龙组与模型组大鼠肝脏及性腺(睾丸、卵巢)中类固醇受体辅助活化因子1和胰岛素样生长因子1基因表达水平差异有显著性意义(P < 0.05,除肝脏中类固醇受体辅助活化因子1);而模型组与对照组大鼠肝脏及性腺(睾丸、卵巢)中类固醇受体辅助活化因子1、c-myc和胰岛素样生长因子1基因表达水平差异无显著性意义(P > 0.05)。说明在不同组织不同生理病理条件下苯丙酸诺龙对类固醇受体辅助活化因子1、c-myc、胰岛素样生长因子1基因表达的作用是不同的。中国组织工程研究杂志出版内容重点：肾移植;肝移植;移植;心脏移植;组织移植;皮肤移植;皮瓣移植;血管移植;器官移植;组织工程     

真核生物Ⅱ类基因转录起始的调控

真核生物Ⅱ类基因的转录起始是一个极其复杂并受到严格调控的过程。有两种转录起始复合物：一种是包含 Ｔ Ｂ Ｐ, Ｔ ＦⅡ和ｐｏｌ Ⅱ的分步组装复合物;另一种是 Ｒ Ｎ Ａ 聚合酶Ⅱ全酶。两条调控途径：一是组蛋白对基因的封闭作用;二是顺式作用元件与反式作用因子的相互作用。目前有关蛋白质 Ｄ Ｎ Ａ 识别的立体化学规律、蛋白质因子 Ｔ ＦⅡ Ｄ（ Ⅱ类基因转录因子 Ｄ） 以及 Ｓｗｉ／ Ｓｎｆ 蛋白在转录起始中的作用的研究均已取得一定进展。当前对转录激活机制的一种新观点为三分体模式。     

Ⅰ型胶原基因转录调控的研究进展

调控Ⅰ型胶原(COL1)基因转录的顺式作用元件位于启动子和第一个内含子中。顺式作用元件及其结合的转录因子有生物种类特异性。一些转录因子以不同的亲和力与其部分潜在结合位点结合,它们间的相互作用稳定了DNA的环状结构,并引发转录。转化生长因子-β(TGF-β)、胰岛素样生长因子-Ⅰ(IGF-Ⅰ)、干扰素-γ(IFN-γ)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)等细胞因子在转录水平参与COL1基因的调控,在COL1基因启动子上有它们的反应元件。     

转录因子MAZ对c1orf109基因转录表达调控的体外研究

目的:本文旨在研究转录因子Myc相关锌指蛋白(MAZ)在体外对人类1号染色体开放阅读框109(c1orf109)基因的转录表达调控。方法:体外条件下,采用凝胶电泳迁移实验筛选c1orf109基因启动子区MAZ的结合位点,并利用本室构建的由c1orf109启动子驱动的增强型绿色荧光蛋白报告载体与MAZ和转录因子特化蛋白1(Sp1)的表达质粒共转染He La细胞,24 h后,用激光共聚焦显微镜和流式细胞术检测c1orf109基因的转录表达情况。结果:c1orf109启动子区可与MAZ结合,且有与Sp1共享的结合位点;MAZ与Sp1皆可抑制c1orf109的转录表达,且Sp1的抑制作用大于MAZ(P0.05)。结论:MAZ与Sp1两个转录因子共同调控c1orf109基因在生理及病理条件的表达,且调控方向一致。这种冗余机制调控方式的存在提示该基因的精确表达调控对于细胞行使其生物学功能可能具有重要意义     

细胞内钙信号对锌指转录因子及胚心标志基因的调控

目的：探讨心肌细胞内游离钙离子浓度（［Ca2+］i）变化对锌指转录因子及胚心标志基因的影响。 方法: 以原代培养的乳鼠心肌细胞为模型，血管紧张素Ⅱ（AngⅡ）及雷尼丁(RY)剌激心肌细胞跨膜钙内流及细胞内钙释放; Fura-2/AM比率荧光成像系统分析细胞内钙信号；免疫印迹(Western blotting)检测心肌细胞钙调神经磷酸酶(CaN)、活化T细胞核因子（NFAT3）、锌指转录因子（GATA4）、α-actin蛋白表达，RT-PCR 检测心肌球蛋白重链（β-MHC）mRNA表达。 结果: AngⅡ及RY均可使心肌细胞内［Ca2+］i增加，与对照组相比差异显著（P<0.01）。AngⅡ、RY刺激1、3 d，心肌细胞CaN、NFAT3、GATA4、α-actin蛋白表达及β-MHC mRNA表达明显高于对照组(P<0.05或P<0.01)。 结论: 细胞内钙信号的变化可能通过影响CaN及ERK信号通路，增加心肌细胞胚心标志基因的表达,在心肌细胞肥大的病理过程中起重要作用。     

T细胞发育过程中的基因转录调控

淋巴细胞分化过程中基因表达调控涉及许多正、负转录调控元件的相互作用.本文以T细胞特异基因αTCR为模型,介绍了该基因的转录调控以及在胸腺细胞发育和T细胞激活过程中调控多种T细胞基因转录因子家族的最新研究进展.     

WT_1基因在转录调控中的作用

WT_1基因于1990年发现,在某些组织中特异表达,它的蛋白质产物在转录调控中起一种双向转录因子作用。它自身表达也受很多因素的调控。本文综述了近年来国内外关于WT_1基因在转录调控方面的作用的研究进展。     

AP-1在基因转录调控中的研究进展

AP- 1是一类二聚体的转录调控因子 ,其作用范围十分广泛 ,在基因转录的调控中有重要作用。 AP- 1对基因转录调控的作用是精细和复杂的 :首先 ,AP- 1家族各成员可以通过亮氨酸拉链形成同源或异源二聚体 ,它们之间的不同比例就包含着不同的调控信息 ;其次 ,AP- 1可与其他蛋白因子协同作用共同决定 AP- 1发挥功能的特异性 ;最后 ,AP- 1序列结合的选择性低 ,因此 AP- 1可以结合在很多基因的不同启动子上对其转录进行调控 ,因而作用范围十分广泛。 AP- 1对基因的转录调控也是多层次的 :如多因子协同作用 ,以及细胞间对话均通过信号传导途经来实现     

Sp3对β-catenin基因转录调控作用初探

 目的:观察转录因子Sp3对β-catenin启动子转录活性的影响,探讨Sp3与Wnt/β-catenin信号通路的关系。方法:采用脂质体法将Sp1和(或)Sp3转录因子表达质粒单独/共同与β-catenin启动子（-410/-1 bp）报告基因质粒瞬时转染HEK293T细胞;通过双萤光素酶报告基因实验检测报告基因转录活性的变化。结果:（1）Sp1表达质粒在0.4 μg剂量时能提高启动子的活性2.4倍,Sp3表达质粒在0.4 μg剂量时能显著提高启动子的活性5.3倍。（2）0.4 μg总量的Sp1与Sp3表达质粒共转染293T细胞,随着Sp3/Sp1比例的递增,β-catenin启动子转录活性无明显变化。（3）共同转染Sp1 0.3 μg与Sp3 0.1 μg时,启动子活性提高3.5倍,比单独转染的转录活性强。结论: Sp3能促进β-catenin基因启动子（-410/-1 bp）的转录,Sp1的转录激活作用则较弱;在转录过程中Sp1和Sp3可能存在协同作用;Sp3可能在转录水平调控β-catenin的表达从而影响Wnt/β-catenin信号通路。     

线粒体基因转录调控机制与人类疾病

人类的线粒体DNA编码了37个基因,这些基因在氧化磷酸化作用中都发挥着重要的作用,而他们表达的失调与人类的疾病和衰老有着密切的联系.除了线粒体基因编码的13个mRNA、12S rRNA、16S rRNA和22个tRNA之外,其他调控线粒体基因的转录、翻译及RNA修饰的因子都由细胞核编码而后转运至线粒体基质中.本文详细讨...     

抗肿瘤药物FTY720对p53依赖的基因转录调控

目的 探究抗肿瘤药物FTY720是否参与p53依赖的基因表达调控,分析FTY720-p53轴潜在的生物学调控作用.方法 在表达野生型p53的人骨肉瘤细胞系U2OS中利用CRISPR/Cas9技术构建p53敲除(p53-KO)的细胞株;将野生型或p53-KO的U2OS细胞给予FTY720处理,通过转录组测序(RNA-se...     

Daxx与蛋白质相互作用对转录调控影响研究进展

死亡结构域相关蛋白(Daxx)是一种多功能的核蛋白,与PML相互作用共定位PML-NB,维持细胞的正常形态与功能。Daxx与PML、SUMO-1、Zacl、ATRX、H3.3、SF-1、AIRE和CREB等蛋白或受体相互作用,发挥转录调控作用,且与这些蛋白质在细胞亚核结构内的定位有关。     

Sp1特异性调控先天性心脏病 相关基因钙调磷酸酶调节蛋白1基因亚型的转录

目的 探索先天性心脏病相关基因钙调磷酸酶调节蛋白1基因(RCAN1)两个亚型(RCAN1-1和RCAN1-4)组织特异性表达的机制.方法 通过生物信息学预测RCAN1-1和RCAN1-4各自启动子区的转录因子结合位点,分析比对并筛选出具有差异的位点,通过定点突变及荧光素酶报告基因系统检测筛选出的位点活性.将鉴定的转录因...     

霍乱弧菌的耐热肠毒素基因及侧翼序列特征分析

霍乱弧菌sto基因编码的热稳定肠毒素(ST)被认为是导致部分霍乱弧菌和拟态弧菌引起腹泻的重要原因[1].霍乱弧菌及拟态弧菌中sto基因的全序列已经被报道,但是对于基因、侧翼序列特征以及在基因组中位点缺乏后继的报道,而这些分析对于探索霍乱弧菌的致病分子机制是十分必要的.     

内质网应激中活化转录因子6通路及相关调控因子对未折叠蛋白反应的调控

目的内质网应激在多种疾病的发病机制中起到关键作用,持续或强烈的内质网应激反应可诱导细胞凋亡。作为一种内质网跨膜蛋白,活化转录因子6(ATF6)可以感受内质网应激并传递信号诱导未折叠蛋白反应。我们主要对ATF6通路以及其调控凋亡的机制进行综述,重要概述了相关激活剂和抑制剂,希望能为一些神经退行性疾病的治疗提供参考。